22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1131 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1131  nuclear export factor GLE1  100 
 
 
149 aa  304  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0525564  hitchhiker  0.00578677 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0925  nuclear export factor GLE1  55.33 
 
 
150 aa  169  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2019  hypothetical protein  37.96 
 
 
206 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1918  hypothetical protein  37.23 
 
 
206 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1775  hypothetical protein  37.23 
 
 
206 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.148709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1913  hypothetical protein  37.23 
 
 
206 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0628905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1950  hypothetical protein  37.23 
 
 
206 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000255275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1754  hypothetical protein  37.23 
 
 
206 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1732  hypothetical protein  37.96 
 
 
206 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3425  hypothetical protein  37.96 
 
 
206 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000164517 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1787  nuclear export factor GLE1  38.69 
 
 
206 aa  93.6  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00148797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1998  hypothetical protein  34.46 
 
 
206 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2625  nuclear export factor GLE1  33.61 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1125  nuclear export factor GLE1  32.87 
 
 
251 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4175  nuclear export factor GLE1  32.87 
 
 
237 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5774  nuclear export factor GLE1  29.93 
 
 
265 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4535  nuclear export factor GLE1  30.38 
 
 
244 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.540264 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1159  nuclear export factor GLE1  33.58 
 
 
233 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  33.07 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  32.97 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7242  nuclear export factor GLE1  29.71 
 
 
247 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00784654  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  29.27 
 
 
277 aa  40  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>