34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1159 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1159  nuclear export factor GLE1  100 
 
 
233 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0042  nuclear export factor GLE1  44.86 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3433  hypothetical protein  36.22 
 
 
250 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000529758  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1276  nuclear export factor GLE1  33.98 
 
 
247 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1123  nuclear export factor GLE1  40 
 
 
247 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551696  normal  0.615467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5783  nuclear export factor GLE1  36.36 
 
 
254 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1014  nuclear export factor GLE1  37.29 
 
 
240 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0744443  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00610  hypothetical protein  38.5 
 
 
230 aa  101  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0768346  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7242  nuclear export factor GLE1  35.81 
 
 
247 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00784654  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0320  nuclear export factor GLE1  45.1 
 
 
251 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0856578  normal  0.260311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3068  nuclear export factor GLE1  36.07 
 
 
253 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00699865  normal  0.0189877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1125  nuclear export factor GLE1  34.68 
 
 
251 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3974  hypothetical protein  32.17 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113102  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4175  nuclear export factor GLE1  33.16 
 
 
237 aa  82  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4535  nuclear export factor GLE1  35.26 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.540264 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  32.96 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1998  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2019  hypothetical protein  30.32 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3425  hypothetical protein  27.27 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000164517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1918  hypothetical protein  29.86 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1732  hypothetical protein  31.82 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1950  hypothetical protein  31.82 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000255275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  28.16 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1754  hypothetical protein  31.82 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1787  nuclear export factor GLE1  30.68 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00148797  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1913  hypothetical protein  31.25 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0628905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1775  hypothetical protein  31.25 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.148709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5774  nuclear export factor GLE1  32.33 
 
 
265 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  28.99 
 
 
327 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  30.49 
 
 
342 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  30.51 
 
 
351 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  30.51 
 
 
334 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2625  nuclear export factor GLE1  33.33 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  27.72 
 
 
320 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>