48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0042 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0042  nuclear export factor GLE1  100 
 
 		 249 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3433  hypothetical protein  46.37 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000529758  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3068  nuclear export factor GLE1  44.62 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00699865  normal  0.0189877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3974  hypothetical protein  42.98 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113102  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1014  nuclear export factor GLE1  47.8 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0744443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7242  nuclear export factor GLE1  42.59 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00784654  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1123  nuclear export factor GLE1  49.72 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551696  normal  0.615467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5783  nuclear export factor GLE1  46.45 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00610  hypothetical protein  44.07 
 
 		 230 aa  136  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0768346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1159  nuclear export factor GLE1  46.4 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1125  nuclear export factor GLE1  39.36 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4175  nuclear export factor GLE1  44.32 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1276  nuclear export factor GLE1  41.12 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4535  nuclear export factor GLE1  44.79 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.540264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0320  nuclear export factor GLE1  44.97 
 
 		 251 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0856578  normal  0.260311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5774  nuclear export factor GLE1  38.22 
 
 		 265 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  32.8 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  32.74 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  33.71 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  35.29 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  37.2 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1787  nuclear export factor GLE1  30.93 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00148797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1754  hypothetical protein  31.11 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1998  hypothetical protein  26.97 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312999  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1732  hypothetical protein  31.25 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1950  hypothetical protein  31.11 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000255275 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1918  hypothetical protein  30.41 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2019  hypothetical protein  30.41 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214878  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  30.05 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  30.05 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  31.88 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1775  hypothetical protein  30.56 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.148709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1913  hypothetical protein  30.56 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0628905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3425  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000164517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  33.1 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  30.99 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  38.03 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  33.12 
 
 		 176 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  31.41 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  31.14 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  30.19 
 
 		 176 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  27.07 
 
 		 327 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  27.22 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2625  nuclear export factor GLE1  31.11 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  25.71 
 
 		 321 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  32.31 
 
 		 177 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  31.94 
 
 		 166 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  26.02 
 
 		 337 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>