32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00610 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00610  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  458  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0768346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0042  nuclear export factor GLE1  40.86 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3433  hypothetical protein  37.14 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000529758  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1159  nuclear export factor GLE1  40.85 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3974  hypothetical protein  38.02 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113102  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1125  nuclear export factor GLE1  38.24 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7242  nuclear export factor GLE1  36 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00784654  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1014  nuclear export factor GLE1  40.12 
 
 		 240 aa  101  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0744443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3068  nuclear export factor GLE1  36.44 
 
 		 253 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00699865  normal  0.0189877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1123  nuclear export factor GLE1  39.31 
 
 		 247 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551696  normal  0.615467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4175  nuclear export factor GLE1  36.42 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4535  nuclear export factor GLE1  32.31 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.540264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1276  nuclear export factor GLE1  33.11 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0320  nuclear export factor GLE1  32.9 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0856578  normal  0.260311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5783  nuclear export factor GLE1  33.33 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  32 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  32.56 
 
 		 166 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1998  hypothetical protein  27.39 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312999  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5774  nuclear export factor GLE1  32.24 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3425  hypothetical protein  31.18 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000164517 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2019  hypothetical protein  27.63 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1950  hypothetical protein  30.95 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000255275 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1732  hypothetical protein  30.95 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1754  hypothetical protein  30.95 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1918  hypothetical protein  26.75 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1787  nuclear export factor GLE1  30.95 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00148797  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1913  hypothetical protein  30.36 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0628905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1775  hypothetical protein  30.36 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.148709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  30.51 
 
 		 351 aa  48.9  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  30.51 
 
 		 334 aa  48.5  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  30.2 
 
 		 178 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  27.87 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>