39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5009 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5009  nuclear export factor GLE1  100 
 
 		 146 aa  286  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  37.66 
 
 		 180 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  36.6 
 
 		 176 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  36.49 
 
 		 176 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  32.75 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  34.12 
 
 		 327 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  35.37 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  33.07 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  38.24 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  34.72 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  31.17 
 
 		 243 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  30.54 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1068  hypothetical protein  34.26 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  32.28 
 
 		 365 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  31.14 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  31.65 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  31.14 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  31.17 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  28.66 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  31.55 
 
 		 324 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  30.72 
 
 		 338 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  29.59 
 
 		 318 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  29.3 
 
 		 176 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  31.29 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  28.29 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  27.86 
 
 		 319 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  29.7 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  29.38 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  35.04 
 
 		 302 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1125  nuclear export factor GLE1  29.82 
 
 		 251 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3433  hypothetical protein  30.12 
 
 		 250 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000529758  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  28.17 
 
 		 184 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3068  nuclear export factor GLE1  27.52 
 
 		 253 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00699865  normal  0.0189877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7242  nuclear export factor GLE1  28.95 
 
 		 247 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00784654  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3974  hypothetical protein  29.05 
 
 		 270 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113102  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5783  nuclear export factor GLE1  29.38 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  23.18 
 
 		 245 aa  40.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  25.48 
 
 		 264 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>