46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1513 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  58.28 
 
 
176 aa  185  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  51.97 
 
 
184 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  46.29 
 
 
175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  47.59 
 
 
302 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  41.92 
 
 
328 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  41.51 
 
 
320 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  40.96 
 
 
337 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  41.29 
 
 
338 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  41.72 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  37.42 
 
 
365 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  36.53 
 
 
357 aa  111  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  43.92 
 
 
178 aa  111  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  35.37 
 
 
357 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  35.9 
 
 
323 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  38.36 
 
 
177 aa  108  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  32.64 
 
 
318 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  38.96 
 
 
176 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  36.94 
 
 
321 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  39.22 
 
 
327 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  39.16 
 
 
319 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  38.67 
 
 
176 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  37.5 
 
 
324 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  36.21 
 
 
351 aa  104  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  36.21 
 
 
334 aa  104  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  39.01 
 
 
176 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  37.36 
 
 
342 aa  101  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  36.48 
 
 
245 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  34.21 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  33.55 
 
 
166 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  31.67 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4175  nuclear export factor GLE1  33.53 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5783  nuclear export factor GLE1  31.18 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  29.88 
 
 
277 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7242  nuclear export factor GLE1  31.15 
 
 
247 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00784654  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1125  nuclear export factor GLE1  29.44 
 
 
251 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5774  nuclear export factor GLE1  30.65 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0042  nuclear export factor GLE1  37.76 
 
 
249 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1014  nuclear export factor GLE1  30.22 
 
 
240 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0744443  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3433  hypothetical protein  28.65 
 
 
250 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000529758  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1276  nuclear export factor GLE1  29.87 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1123  nuclear export factor GLE1  28.73 
 
 
247 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551696  normal  0.615467 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5009  nuclear export factor GLE1  26.92 
 
 
146 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0320  nuclear export factor GLE1  32.56 
 
 
251 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0856578  normal  0.260311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3974  hypothetical protein  27.18 
 
 
270 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113102  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3068  nuclear export factor GLE1  32.81 
 
 
253 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00699865  normal  0.0189877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>