More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0750 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0750  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 407 aa  813    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0016093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2939  30S ribosomal protein S1  59.23 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0991  30S ribosomal protein S1  58.04 
 
 		 400 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3269  30S ribosomal protein S1  57.79 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1102  30S ribosomal protein S1  57.5 
 
 		 401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000946853  normal  0.0119462 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1200  30S ribosomal protein S1  56.11 
 
 		 402 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000802868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2672  30S ribosomal protein S1  52.76 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2022  30S ribosomal protein S1  40.79 
 
 		 472 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000578746  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2011  30S ribosomal protein S1  38.94 
 
 		 482 aa  249  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0546  RNA binding S1 domain protein  38.97 
 
 		 410 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0309  30S ribosomal protein S1  38.48 
 
 		 564 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.470191 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  36.81 
 
 		 573 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  37.18 
 
 		 561 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  36.89 
 
 		 560 aa  239  8e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1610  30S ribosomal protein S1  40 
 
 		 487 aa  239  9e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  35.98 
 
 		 584 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1207  30S ribosomal protein S1  38.66 
 
 		 489 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  36.9 
 
 		 559 aa  238  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  35.98 
 
 		 584 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  36.31 
 
 		 558 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  37.18 
 
 		 560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  35.42 
 
 		 720 aa  233  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  37.27 
 
 		 574 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  36.89 
 
 		 558 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  36.89 
 
 		 558 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  36.02 
 
 		 559 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  34.38 
 
 		 574 aa  229  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  37.93 
 
 		 568 aa  229  7e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  37.93 
 
 		 568 aa  229  7e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  36.31 
 
 		 559 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  36.31 
 
 		 559 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  35.45 
 
 		 556 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  36.31 
 
 		 559 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  36.6 
 
 		 558 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  36.6 
 
 		 558 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2122  30S ribosomal protein S1  34.69 
 
 		 492 aa  227  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000709036  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  36.6 
 
 		 558 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  36.6 
 
 		 558 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  36.02 
 
 		 560 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  39.82 
 
 		 403 aa  226  7e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  35.65 
 
 		 584 aa  225  9e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  36.36 
 
 		 561 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  36.08 
 
 		 561 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  36.08 
 
 		 561 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  34.28 
 
 		 577 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  34.87 
 
 		 560 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  35.16 
 
 		 557 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  32.29 
 
 		 596 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1494  30S ribosomal protein S1  36.02 
 
 		 563 aa  223  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805481  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0976  30S ribosomal protein S1  36.31 
 
 		 547 aa  224  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00186692  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  32.49 
 
 		 593 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  37.11 
 
 		 677 aa  223  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2855  30S ribosomal protein S1  34.72 
 
 		 560 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000740795  hitchhiker  0.0000000202949 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  35.73 
 
 		 563 aa  222  7e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  33.43 
 
 		 577 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  36 
 
 		 571 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  36.31 
 
 		 557 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  35.68 
 
 		 579 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  37.18 
 
 		 553 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  38.01 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  35.05 
 
 		 676 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  35.51 
 
 		 563 aa  220  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  35.16 
 
 		 561 aa  219  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  37.33 
 
 		 586 aa  219  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  33.06 
 
 		 575 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  33.9 
 
 		 562 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 576 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 576 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 576 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 576 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  34.2 
 
 		 567 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  35.51 
 
 		 571 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  34.58 
 
 		 588 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  33.14 
 
 		 564 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  35.53 
 
 		 570 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  33.14 
 
 		 564 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0255  30S ribosomal protein S1  33.72 
 
 		 558 aa  217  2.9999999999999998e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0579142  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  33.62 
 
 		 562 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  33.62 
 
 		 562 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  35.29 
 
 		 571 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  37.76 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1280  30S ribosomal protein S1  34.29 
 
 		 559 aa  216  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 577 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  34.96 
 
 		 569 aa  215  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  35.24 
 
 		 570 aa  215  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  33.05 
 
 		 570 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  35.24 
 
 		 557 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  34.17 
 
 		 571 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  34.17 
 
 		 589 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>