More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3461 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 328 aa  676    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  52.83 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4531  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  42.92 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4209  chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 		 434 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.81 
 
 		 430 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0935  methyl-accepting chemotaxis protein  40.57 
 
 		 407 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1957  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0130  chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 491 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.36 
 
 		 674 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.91 
 
 		 675 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0763  methyl-accepting chemotaxis protein  72.86 
 
 		 661 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.01 
 
 		 676 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0859  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.46 
 
 		 673 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4372  methyl-accepting chemotaxis protein  80.6 
 
 		 619 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.46 
 
 		 673 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.37 
 
 		 573 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.37 
 
 		 573 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.46 
 
 		 675 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.547128  hitchhiker  0.00024543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.97 
 
 		 542 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.01 
 
 		 673 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  63.74 
 
 		 629 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  63.74 
 
 		 629 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.29 
 
 		 548 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2891  chemotaxis sensory transducer  71.01 
 
 		 673 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.03 
 
 		 541 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.77 
 
 		 624 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.78 
 
 		 573 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.476047  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  63.74 
 
 		 632 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  63.74 
 
 		 632 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  59.14 
 
 		 545 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  71.43 
 
 		 638 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3642  methyl-accepting chemotaxis protein  71.01 
 
 		 673 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.56 
 
 		 552 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.33 
 
 		 541 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.56 
 
 		 552 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  60.67 
 
 		 738 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.56 
 
 		 542 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2435  chemotaxis sensory transducer  79.69 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  65.43 
 
 		 714 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0986  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.01 
 
 		 673 aa  99.8  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.603679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  78.12 
 
 		 572 aa  99.8  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  69.44 
 
 		 539 aa  99.4  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  67.53 
 
 		 541 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  58.76 
 
 		 690 aa  99.4  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.37 
 
 		 666 aa  99.4  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2502  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.36 
 
 		 649 aa  99.4  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.988754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  62.64 
 
 		 629 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.76 
 
 		 554 aa  99  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28050  putative chemotaxis transducer  46.36 
 
 		 531 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2826  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.29 
 
 		 579 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0277282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4057  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.78 
 
 		 537 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.03 
 
 		 620 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.78 
 
 		 714 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  54.29 
 
 		 629 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.19 
 
 		 572 aa  99  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0122  methyl-accepting chemotaxis protein  60 
 
 		 553 aa  98.6  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.03 
 
 		 620 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  75 
 
 		 681 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003886  methyl-accepting chemotaxis protein  71.43 
 
 		 542 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  77.78 
 
 		 545 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1626  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.29 
 
 		 579 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.154062  normal  0.0682347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3842  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.38 
 
 		 537 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000516027 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  80.33 
 
 		 541 aa  98.6  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  80.65 
 
 		 620 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.03 
 
 		 620 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0445  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.26 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.29 
 
 		 579 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4273  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  50.98 
 
 		 499 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.29 
 
 		 579 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  62.64 
 
 		 629 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.42 
 
 		 541 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000751538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.03 
 
 		 620 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  68.12 
 
 		 674 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70 
 
 		 654 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2374  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.65 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  76.19 
 
 		 568 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  73.44 
 
 		 672 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  64.63 
 
 		 545 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  80.33 
 
 		 541 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  58.24 
 
 		 624 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  68.92 
 
 		 629 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.6 
 
 		 531 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  64.2 
 
 		 714 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.42 
 
 		 620 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75 
 
 		 621 aa  97.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58650  putative chemotaxis transducer  53.27 
 
 		 673 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5137  putative chemotaxis transducer  53.27 
 
 		 673 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1012  hypothetical protein  66.2 
 
 		 626 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0916  methyl-accepting chemotaxis protein  73.02 
 
 		 543 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029497  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  68.57 
 
 		 650 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  78.69 
 
 		 541 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.57 
 
 		 673 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1117  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.33 
 
 		 541 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0100073  normal  0.0339889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.57 
 
 		 673 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.11 
 
 		 683 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.33 
 
 		 541 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0175031  normal  0.083895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.57 
 
 		 673 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.33 
 
 		 541 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000434326  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3173  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.33 
 
 		 541 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0131988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0767  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.91 
 
 		 546 aa  97.4  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>