More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4531 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4531  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  100 
 
 		 434 aa  891    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4209  chemotaxis sensory transducer  93.55 
 
 		 434 aa  829    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0935  methyl-accepting chemotaxis protein  58.54 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.25 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0130  chemotaxis sensory transducer  42.52 
 
 		 491 aa  296  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1957  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.49 
 
 		 344 aa  232  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.92 
 
 		 328 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4355  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 425 aa  160  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.76 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1802  chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 		 438 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 3706 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 		 1342 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 		 1109 aa  106  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 		 1977 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  27.68 
 
 		 749 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 987 aa  97.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 2693 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3902  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.47 
 
 		 990 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 1654 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.33 
 
 		 655 aa  94.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  64.2 
 
 		 549 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  69.57 
 
 		 626 aa  94.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.28 
 
 		 656 aa  94  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 		 689 aa  94  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  69.57 
 
 		 627 aa  93.6  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2016  methyl-accepting chemotaxis protein  61.54 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000104003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0515  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.28 
 
 		 656 aa  93.2  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.28 
 
 		 661 aa  93.2  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.28 
 
 		 661 aa  93.2  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  74.19 
 
 		 549 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  75.81 
 
 		 533 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  62.86 
 
 		 559 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.42 
 
 		 518 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  72.58 
 
 		 671 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2933  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  56.25 
 
 		 540 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.3489100000000001e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.81 
 
 		 550 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.01 
 
 		 1057 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.67 
 
 		 628 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  61.97 
 
 		 561 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  61.97 
 
 		 561 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.23 
 
 		 546 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1363  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  64.1 
 
 		 438 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.4426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  77.42 
 
 		 645 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2075  methyl-accepting chemotaxis protein  64.29 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.35 
 
 		 1076 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.87 
 
 		 762 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.62 
 
 		 544 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.81 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.22 
 
 		 545 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004525  methyl-accepting chemotaxis protein  60.26 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.81 
 
 		 557 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 		 1501 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.19 
 
 		 543 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.65 
 
 		 655 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  63.38 
 
 		 476 aa  91.3  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.18 
 
 		 498 aa  91.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3916  putative chemotaxis transducer  65.71 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46030  putative chemotaxis transducer  65.71 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  66.67 
 
 		 626 aa  91.3  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.64 
 
 		 546 aa  91.3  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  74.19 
 
 		 528 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  61.97 
 
 		 560 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.19 
 
 		 550 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.11 
 
 		 664 aa  90.9  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.11 
 
 		 664 aa  90.9  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00866  hypothetical protein  65.71 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  72.58 
 
 		 541 aa  90.5  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1267  methyl-accepting chemotaxis protein  45.45 
 
 		 557 aa  90.5  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.33 
 
 		 700 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0122  methyl-accepting chemotaxis protein  65.71 
 
 		 553 aa  90.5  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.57 
 
 		 671 aa  90.9  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.57 
 
 		 547 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0128  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.31 
 
 		 663 aa  90.5  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0154965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.81 
 
 		 822 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.19 
 
 		 563 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.44 
 
 		 532 aa  90.1  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.82 
 
 		 566 aa  90.1  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2883  chemotaxis sensory transducer  69.12 
 
 		 537 aa  90.5  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.44547e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.19 
 
 		 700 aa  90.1  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.44 
 
 		 532 aa  90.1  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.19 
 
 		 537 aa  89.7  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0364  PAS sensor protein  23.51 
 
 		 501 aa  89.7  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.43 
 
 		 549 aa  90.1  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0916  methyl-accepting chemotaxis protein  68.06 
 
 		 543 aa  89.7  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.19 
 
 		 538 aa  89.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0588  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.29 
 
 		 434 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.19 
 
 		 569 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1330 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  64.29 
 
 		 434 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  37.04 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.98 
 
 		 830 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  73.02 
 
 		 544 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  37.04 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2554  chemotaxis sensory transducer  60 
 
 		 663 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4308  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  39.62 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.19 
 
 		 570 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  61.11 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.19 
 
 		 540 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.566239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.58 
 
 		 542 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>