More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0935 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0935  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
407 aa  826    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4531  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  58.54 
 
 
434 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4209  chemotaxis sensory transducer  59.54 
 
 
434 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.24 
 
 
430 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0130  chemotaxis sensory transducer  39.27 
 
 
491 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1957  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 
344 aa  219  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.57 
 
 
328 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.79 
 
 
428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.56 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4355  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.65 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1802  chemotaxis sensory transducer  37.81 
 
 
438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 
1342 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
3706 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 
1057 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  30.99 
 
 
872 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
2693 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  27.67 
 
 
749 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
1002 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  30.03 
 
 
1041 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
1016 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
944 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
897 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  29.73 
 
 
1037 aa  97.4  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
1090 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
1090 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3902  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.33 
 
 
990 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.45 
 
 
1927 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  61.45 
 
 
543 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
689 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
1001 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
1654 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3012  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.12 
 
 
619 aa  91.3  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 
655 aa  91.3  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.78 
 
 
1977 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 
661 aa  90.9  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 
656 aa  90.9  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 
661 aa  90.9  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3294  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.79 
 
 
524 aa  90.9  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0515  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 
656 aa  90.9  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.27 
 
 
636 aa  90.5  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 
1330 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
1092 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  28.99 
 
 
1560 aa  90.1  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.08 
 
 
1501 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
582 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.25 
 
 
714 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
1273 aa  88.2  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.14 
 
 
509 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.14 
 
 
642 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156907  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  30.71 
 
 
1086 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  51.25 
 
 
627 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
1068 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.08 
 
 
524 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.08 
 
 
524 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.08 
 
 
524 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.08 
 
 
524 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4974  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.55 
 
 
877 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.25 
 
 
573 aa  87  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.476047  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0046  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.9 
 
 
563 aa  87  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 
799 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
646 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.5 
 
 
547 aa  87  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0584  methyl-accepting chemotaxis protein  53.75 
 
 
524 aa  86.7  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  50.62 
 
 
521 aa  86.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0413099 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  26.3 
 
 
685 aa  86.3  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
1086 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004525  methyl-accepting chemotaxis protein  62.9 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.55 
 
 
550 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  51.9 
 
 
526 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
1118 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.94 
 
 
647 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0583  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.81 
 
 
524 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.344402 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3447  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.81 
 
 
524 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 
663 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  51.19 
 
 
549 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.94 
 
 
1148 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.4 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.01 
 
 
550 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1279  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.8 
 
 
728 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000558964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.17 
 
 
572 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.38 
 
 
1126 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
934 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
1068 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
664 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0582  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.81 
 
 
524 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  54.79 
 
 
638 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
1134 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.5 
 
 
677 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.787316  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
745 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.32 
 
 
1051 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.55 
 
 
509 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.93 
 
 
573 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
1215 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  66.13 
 
 
648 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 
1193 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0558  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
763 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.043921  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 
1193 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.05 
 
 
662 aa  84.7  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003151  methyl-accepting chemotaxis protein  50.67 
 
 
541 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00103096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.65 
 
 
1344 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>