More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0130 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0130  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 491 aa  1001    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4209  chemotaxis sensory transducer  42.78 
 
 		 434 aa  299  9e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4531  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  42.52 
 
 		 434 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0935  methyl-accepting chemotaxis protein  39.27 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.72 
 
 		 428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4355  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.55 
 
 		 425 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1802  chemotaxis sensory transducer  41.07 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1957  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.92 
 
 		 344 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.85 
 
 		 430 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2441  methyl-accepting chemotaxis protein  30.04 
 
 		 710 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323327  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1769  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  25.98 
 
 		 692 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000694205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2214  PAS  30.04 
 
 		 710 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 3706 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3592  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.51 
 
 		 681 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.52 
 
 		 530 aa  97.8  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 2693 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  27.46 
 
 		 749 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  40.94 
 
 		 713 aa  94.7  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1128  methyl-accepting chemotaxis protein  31.42 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0612  methyl-accepting chemotaxis protein  31.96 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1253  methyl-accepting chemotaxis protein  31.42 
 
 		 429 aa  92.4  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001528  putative chemotaxis transducer  53 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4692  methyl-accepting chemotaxis protein  35.35 
 
 		 533 aa  91.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  42.52 
 
 		 634 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 		 689 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.84 
 
 		 715 aa  91.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 		 620 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 		 620 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 		 620 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1991  chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 		 661 aa  90.5  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 		 632 aa  90.5  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  37.18 
 
 		 633 aa  90.1  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3644  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.7 
 
 		 378 aa  90.1  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3242  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  34.12 
 
 		 880 aa  90.1  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.27 
 
 		 832 aa  90.1  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365743  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  33.66 
 
 		 545 aa  90.1  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 1654 aa  90.1  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.33 
 
 		 600 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112529 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0285  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.74 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 1086 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.33 
 
 		 600 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0503971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.65 
 
 		 702 aa  89.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.650804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.97 
 
 		 658 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.32 
 
 		 620 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  33.33 
 
 		 627 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.15 
 
 		 522 aa  89  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 		 524 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419137  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1002  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  37.21 
 
 		 1100 aa  89  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1594  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 534 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0606  methyl-accepting chemotaxis protein  38.89 
 
 		 587 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 635 aa  88.6  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.779847  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 		 631 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 		 699 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2743  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.52 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2794  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.31 
 
 		 717 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2175  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 		 530 aa  88.6  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3916  putative chemotaxis transducer  29.14 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 		 1342 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4591  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 		 565 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.521693  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.91 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 		 565 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.430546 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.16 
 
 		 549 aa  88.2  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 		 564 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.96 
 
 		 506 aa  87.8  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.538358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 1714 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  30.81 
 
 		 626 aa  87.8  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.12 
 
 		 561 aa  87.8  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056342  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0618  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 583 aa  87.8  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.31 
 
 		 634 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3519  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  34.78 
 
 		 514 aa  87.4  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02969  Methyl-accepting chemotaxis protein  35.11 
 
 		 529 aa  87.4  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0476708  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000502  methyl-accepting chemotaxis protein  47.9 
 
 		 589 aa  87  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.567249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0322  methyl-accepting chemotaxis protein  29.74 
 
 		 432 aa  87  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 		 638 aa  87  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.408395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1396  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.31 
 
 		 548 aa  87  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.664947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1674  methyl-accepting chemotaxis protein  36.77 
 
 		 647 aa  87  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 		 1011 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.15 
 
 		 492 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4122  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.5 
 
 		 676 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1802  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  36.49 
 
 		 515 aa  86.7  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0853497  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0279  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 		 638 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.983838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3307  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  34.52 
 
 		 646 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1937  methyl-accepting chemotaxis protein  46.36 
 
 		 662 aa  85.9  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0745  putative methyl-accepting chemotaxis protein  36.77 
 
 		 558 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  52.81 
 
 		 546 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0931  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  36.77 
 
 		 653 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0143  chemotaxis sensory transducer  39.52 
 
 		 506 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0417  putative methyl-accepting chemotaxis protein  36.77 
 
 		 558 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 		 638 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.411591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1850  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  36.77 
 
 		 653 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1696  methyl-accepting chemotaxis protein  36.77 
 
 		 647 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0745582  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 		 638 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2456  methyl-accepting protein IV  42.76 
 
 		 533 aa  86.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.31 
 
 		 513 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.34 
 
 		 620 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 		 641 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3929  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.9 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.320074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  29.84 
 
 		 539 aa  86.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3736  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.34 
 
 		 620 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.0212994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>