More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32401 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  38.57 
 
 		 1535 aa  993    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  43.03 
 
 		 1157 aa  928    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  82.33 
 
 		 1640 aa  2628    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  100 
 
 		 1573 aa  3211    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  37.74 
 
 		 1587 aa  850    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  40.37 
 
 		 1549 aa  1021    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  42.83 
 
 		 1549 aa  1214    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  30.61 
 
 		 1667 aa  627  1e-178  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  29.88 
 
 		 1636 aa  624  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  32.96 
 
 		 1168 aa  621  1e-176  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  30.31 
 
 		 1256 aa  618  1e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  31.85 
 
 		 1317 aa  603  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  31.78 
 
 		 1135 aa  605  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  31.17 
 
 		 1367 aa  594  1e-168  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  30.25 
 
 		 1423 aa  571  1e-161  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  30.59 
 
 		 1458 aa  555  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  30.75 
 
 		 1381 aa  550  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  30.05 
 
 		 1507 aa  548  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  28.2 
 
 		 1669 aa  525  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.94 
 
 		 1705 aa  521  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  29.84 
 
 		 1248 aa  518  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.16 
 
 		 1659 aa  508  9.999999999999999e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  36.11 
 
 		 1513 aa  502  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  30.37 
 
 		 1127 aa  499  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  27.57 
 
 		 1611 aa  491  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  30.23 
 
 		 1351 aa  479  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  29.61 
 
 		 1514 aa  472  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.45 
 
 		 1456 aa  442  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  27.87 
 
 		 1463 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  26.63 
 
 		 1557 aa  417  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  28.14 
 
 		 1607 aa  416  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.83 
 
 		 1396 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.85 
 
 		 1115 aa  359  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  34.93 
 
 		 1623 aa  337  9e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  25.46 
 
 		 1562 aa  335  4e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  36.79 
 
 		 1416 aa  327  8.000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  26.91 
 
 		 1511 aa  193  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  31.23 
 
 		 610 aa  193  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  28.27 
 
 		 725 aa  192  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  28.14 
 
 		 621 aa  191  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  27.53 
 
 		 622 aa  189  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  29.46 
 
 		 622 aa  189  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.85 
 
 		 583 aa  187  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  28.71 
 
 		 728 aa  186  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  29.42 
 
 		 590 aa  184  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.2 
 
 		 589 aa  184  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  30.58 
 
 		 640 aa  183  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  29.64 
 
 		 590 aa  181  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  28.23 
 
 		 728 aa  181  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.31 
 
 		 597 aa  180  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  28.57 
 
 		 607 aa  178  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  29.43 
 
 		 609 aa  178  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  30.33 
 
 		 727 aa  178  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  30.47 
 
 		 610 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.39 
 
 		 603 aa  177  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  30.47 
 
 		 610 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.51 
 
 		 1773 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  27.66 
 
 		 611 aa  177  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  30.35 
 
 		 739 aa  177  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  27.88 
 
 		 592 aa  177  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.12 
 
 		 597 aa  177  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2206  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.5 
 
 		 612 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  27.19 
 
 		 626 aa  176  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  27.08 
 
 		 608 aa  175  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 608 aa  175  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  27.67 
 
 		 699 aa  175  7.999999999999999e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  27.7 
 
 		 613 aa  175  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  29.21 
 
 		 590 aa  174  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  25.93 
 
 		 601 aa  174  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.01 
 
 		 738 aa  174  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3827  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  27.29 
 
 		 610 aa  173  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 		 706 aa  174  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  27.64 
 
 		 610 aa  174  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  27.13 
 
 		 616 aa  173  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  28.54 
 
 		 594 aa  172  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.86 
 
 		 1019 aa  172  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  28.31 
 
 		 590 aa  172  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.69 
 
 		 1000 aa  172  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4091  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27 
 
 		 610 aa  172  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0803284  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.19 
 
 		 589 aa  171  7e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  28.16 
 
 		 592 aa  172  7e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  27.85 
 
 		 622 aa  172  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.32 
 
 		 971 aa  171  8e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  28.92 
 
 		 714 aa  171  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  28.28 
 
 		 705 aa  171  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  26.8 
 
 		 609 aa  171  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  27.54 
 
 		 724 aa  171  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  26.11 
 
 		 590 aa  171  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  27.54 
 
 		 724 aa  171  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  26.9 
 
 		 743 aa  171  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  28.98 
 
 		 619 aa  170  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  27.81 
 
 		 634 aa  170  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.45 
 
 		 1003 aa  170  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  27.75 
 
 		 593 aa  170  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  28.24 
 
 		 609 aa  170  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  28.74 
 
 		 592 aa  170  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1105  ABC transporter related protein  28.03 
 
 		 573 aa  170  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  28.74 
 
 		 623 aa  170  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.8 
 
 		 599 aa  170  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1588  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.71 
 
 		 612 aa  169  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>