More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9180 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  100 
 
 
1248 aa  2558    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.09 
 
 
1396 aa  600  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  31.87 
 
 
1535 aa  575  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  32.99 
 
 
1317 aa  566  1.0000000000000001e-159  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  31.62 
 
 
1549 aa  561  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  32.02 
 
 
1168 aa  554  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  30.44 
 
 
1256 aa  550  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  32.38 
 
 
1135 aa  546  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  29.53 
 
 
1367 aa  504  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  31.1 
 
 
1640 aa  501  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  30.02 
 
 
1549 aa  499  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  29.52 
 
 
1573 aa  498  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  31.1 
 
 
1127 aa  497  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  29.56 
 
 
1636 aa  490  1e-137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0930816 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  29.03 
 
 
1667 aa  493  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  31.91 
 
 
1157 aa  487  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  28.48 
 
 
1381 aa  485  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  35.28 
 
 
1513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  34.29 
 
 
1423 aa  457  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  33.15 
 
 
1458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.87 
 
 
1623 aa  442  9.999999999999999e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  28.76 
 
 
1507 aa  431  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.68 
 
 
1705 aa  431  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  27.82 
 
 
1351 aa  428  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  34.34 
 
 
1416 aa  422  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  28.57 
 
 
1514 aa  419  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866258 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.58 
 
 
1456 aa  414  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  27.26 
 
 
1659 aa  391  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  26.87 
 
 
1557 aa  379  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  29.57 
 
 
1611 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.576912 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  36.23 
 
 
1587 aa  360  9e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  27.43 
 
 
1607 aa  360  9.999999999999999e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  27.2 
 
 
1463 aa  350  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.09 
 
 
1115 aa  334  6e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  26.45 
 
 
1562 aa  289  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  25.14 
 
 
1511 aa  286  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.05 
 
 
1773 aa  255  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.91 
 
 
1669 aa  250  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  27.67 
 
 
1179 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  27.67 
 
 
1201 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.69 
 
 
1179 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  27.99 
 
 
1179 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  27.99 
 
 
1179 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  29.61 
 
 
597 aa  206  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  29.38 
 
 
610 aa  202  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.33 
 
 
581 aa  202  3e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  30.54 
 
 
610 aa  201  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  33.21 
 
 
609 aa  201  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  28.79 
 
 
625 aa  201  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  28.95 
 
 
582 aa  200  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.4 
 
 
1003 aa  199  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  31.02 
 
 
594 aa  197  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.65 
 
 
976 aa  197  9e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.85 
 
 
971 aa  197  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.38 
 
 
589 aa  197  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  28.65 
 
 
765 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03608  ABC transporter protein AtrC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y748]  25.74 
 
 
1266 aa  195  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  26.27 
 
 
1228 aa  194  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  28.86 
 
 
663 aa  194  9e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  29.06 
 
 
733 aa  194  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  29.66 
 
 
930 aa  194  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  27.73 
 
 
572 aa  194  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  30.6 
 
 
591 aa  194  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  31.56 
 
 
666 aa  194  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0921  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.96 
 
 
579 aa  192  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.451099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  32.01 
 
 
600 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  29.74 
 
 
592 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  30.72 
 
 
600 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  29.46 
 
 
631 aa  191  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  28.29 
 
 
597 aa  191  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  28.29 
 
 
597 aa  191  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  27.18 
 
 
1218 aa  190  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  31.83 
 
 
592 aa  190  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  27.5 
 
 
1218 aa  190  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  26.97 
 
 
615 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.21 
 
 
1024 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  28.96 
 
 
587 aa  189  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  27.08 
 
 
1264 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.25 
 
 
597 aa  188  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  28.23 
 
 
618 aa  188  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  30.65 
 
 
622 aa  188  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.59 
 
 
579 aa  188  7e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  30.57 
 
 
669 aa  187  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  28.44 
 
 
587 aa  187  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  29.9 
 
 
622 aa  187  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  27.97 
 
 
986 aa  187  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  28.44 
 
 
587 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  28.44 
 
 
587 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.81 
 
 
1006 aa  187  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  28.96 
 
 
587 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.44 
 
 
587 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.44 
 
 
587 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.23 
 
 
618 aa  187  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  30.8 
 
 
603 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 
596 aa  187  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  31.78 
 
 
611 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  26.94 
 
 
575 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  31.38 
 
 
610 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  30.02 
 
 
675 aa  187  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  40.79 
 
 
598 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>