More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_49071 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.3 
 
 		 1396 aa  953    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  35.8 
 
 		 1513 aa  840    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  48.93 
 
 		 1367 aa  1384    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  49.38 
 
 		 1381 aa  1360    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  64.58 
 
 		 1423 aa  1887    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  100 
 
 		 1458 aa  2998    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  31.3 
 
 		 1507 aa  587  1e-166  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  29.65 
 
 		 1587 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  31.25 
 
 		 1549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  35.85 
 
 		 1317 aa  567  1e-160  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  37.79 
 
 		 1535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  35.67 
 
 		 1256 aa  560  1e-158  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  31.02 
 
 		 1157 aa  555  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  36.35 
 
 		 1135 aa  548  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  29.38 
 
 		 1640 aa  530  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  36.8 
 
 		 1549 aa  530  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  33.86 
 
 		 1636 aa  530  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  36.19 
 
 		 1573 aa  505  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  30.45 
 
 		 1611 aa  496  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  26.7 
 
 		 1416 aa  490  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  29.04 
 
 		 1127 aa  481  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.43 
 
 		 1705 aa  478  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  33.19 
 
 		 1168 aa  474  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  33.48 
 
 		 1248 aa  455  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.42 
 
 		 1456 aa  444  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  31.12 
 
 		 1514 aa  437  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.3 
 
 		 1659 aa  433  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  39.82 
 
 		 1667 aa  427  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  25.62 
 
 		 1351 aa  420  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  30.27 
 
 		 1557 aa  412  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  27.4 
 
 		 1607 aa  396  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  30.49 
 
 		 1463 aa  369  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  24.38 
 
 		 1511 aa  351  7e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.65 
 
 		 1115 aa  348  6e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  32.95 
 
 		 1669 aa  345  5e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  34.09 
 
 		 1623 aa  331  8e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  27.94 
 
 		 1562 aa  307  1.0000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.19 
 
 		 1773 aa  214  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  28.35 
 
 		 592 aa  202  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.09 
 
 		 589 aa  190  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  30.52 
 
 		 642 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  28.1 
 
 		 594 aa  189  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  27.9 
 
 		 594 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  27.27 
 
 		 594 aa  184  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  27.26 
 
 		 587 aa  184  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  27.44 
 
 		 607 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.64 
 
 		 581 aa  181  9e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.88 
 
 		 641 aa  181  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  26.57 
 
 		 622 aa  178  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  26.43 
 
 		 587 aa  178  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  25.97 
 
 		 587 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1391  ABC transporter permease  26.92 
 
 		 594 aa  177  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.4 
 
 		 599 aa  177  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  27.08 
 
 		 666 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.28 
 
 		 597 aa  176  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  27.42 
 
 		 631 aa  177  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.6 
 
 		 596 aa  176  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  27.69 
 
 		 634 aa  176  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  30.78 
 
 		 677 aa  176  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  27.96 
 
 		 592 aa  175  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  25.84 
 
 		 600 aa  175  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.68 
 
 		 639 aa  175  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  26.17 
 
 		 600 aa  175  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  25.73 
 
 		 587 aa  175  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0921  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.63 
 
 		 579 aa  174  7.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.451099  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  27.37 
 
 		 628 aa  174  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  27.05 
 
 		 587 aa  174  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  27.05 
 
 		 587 aa  173  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  27.05 
 
 		 587 aa  173  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  26.04 
 
 		 971 aa  173  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.05 
 
 		 587 aa  173  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.05 
 
 		 587 aa  173  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.27 
 
 		 606 aa  173  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03608  ABC transporter protein AtrC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y748]  23.46 
 
 		 1266 aa  172  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.88 
 
 		 587 aa  172  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  25.5 
 
 		 600 aa  172  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  29.78 
 
 		 594 aa  172  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  25.13 
 
 		 580 aa  172  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.51 
 
 		 587 aa  172  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  25.87 
 
 		 739 aa  171  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  27.75 
 
 		 611 aa  171  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  28.6 
 
 		 590 aa  171  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.56 
 
 		 628 aa  171  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  27.59 
 
 		 627 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  27.8 
 
 		 606 aa  169  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  27.18 
 
 		 598 aa  169  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  26.64 
 
 		 610 aa  169  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.43 
 
 		 677 aa  169  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.18 
 
 		 579 aa  168  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  26.19 
 
 		 592 aa  168  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  26.45 
 
 		 588 aa  168  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.08 
 
 		 637 aa  168  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  24.49 
 
 		 1218 aa  168  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  28.51 
 
 		 663 aa  167  9e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.46 
 
 		 1006 aa  167  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  27.83 
 
 		 597 aa  167  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  24.77 
 
 		 606 aa  167  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  25.88 
 
 		 613 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  25.04 
 
 		 741 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0917  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.6 
 
 		 593 aa  167  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>