More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43299 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  100 
 
 
1416 aa  2902    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  46.45 
 
 
1127 aa  1024    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  29.48 
 
 
1396 aa  604  1.0000000000000001e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  31.95 
 
 
1168 aa  594  1e-168  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  31.62 
 
 
1256 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  28.35 
 
 
1636 aa  575  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  33.14 
 
 
1135 aa  571  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  28.27 
 
 
1667 aa  555  1e-156  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  28.61 
 
 
1513 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  31.3 
 
 
1157 aa  506  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  36.03 
 
 
1317 aa  505  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  28.22 
 
 
1367 aa  500  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  27.83 
 
 
1458 aa  496  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  27.44 
 
 
1423 aa  499  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  28.16 
 
 
1381 aa  493  9.999999999999999e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  28.52 
 
 
1669 aa  460  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  28.54 
 
 
1507 aa  459  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  27.62 
 
 
1623 aa  427  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  34.34 
 
 
1248 aa  429  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  28.79 
 
 
1514 aa  418  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866258 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.49 
 
 
1456 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  28.98 
 
 
1607 aa  394  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  26.58 
 
 
1705 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  27.95 
 
 
1463 aa  364  5.0000000000000005e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.59 
 
 
1115 aa  364  8e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  27.21 
 
 
1611 aa  359  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.576912 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  25.33 
 
 
1557 aa  344  5.999999999999999e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  38.46 
 
 
1535 aa  340  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  37.76 
 
 
1587 aa  332  3e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  34.75 
 
 
1549 aa  330  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  37.33 
 
 
1640 aa  325  4e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  37.67 
 
 
1573 aa  320  1e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  36.19 
 
 
1549 aa  301  6e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  34.27 
 
 
1659 aa  283  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  34.25 
 
 
1351 aa  271  8.999999999999999e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  30.02 
 
 
1562 aa  214  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  29.84 
 
 
1511 aa  196  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  30.32 
 
 
811 aa  192  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.62 
 
 
587 aa  190  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  28.62 
 
 
587 aa  190  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 
587 aa  191  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 
587 aa  190  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.62 
 
 
587 aa  190  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.96 
 
 
587 aa  189  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  27.59 
 
 
587 aa  189  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.52 
 
 
1773 aa  189  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.96 
 
 
587 aa  189  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.8 
 
 
589 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00401  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  30.11 
 
 
593 aa  185  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3160  ABC transporter related protein  30.11 
 
 
593 aa  185  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00405  hypothetical protein  30.11 
 
 
593 aa  185  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0526  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.11 
 
 
593 aa  185  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0537  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.11 
 
 
593 aa  185  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0485  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.11 
 
 
593 aa  185  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3166  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.11 
 
 
593 aa  185  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  30.13 
 
 
765 aa  185  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  27.12 
 
 
587 aa  185  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0492  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.93 
 
 
593 aa  184  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  30.16 
 
 
672 aa  184  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  29.29 
 
 
594 aa  181  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3079  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.82 
 
 
607 aa  181  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.59 
 
 
581 aa  181  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0752  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  29.31 
 
 
666 aa  179  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3221  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.82 
 
 
607 aa  180  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  28.89 
 
 
663 aa  179  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0943  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.04 
 
 
666 aa  179  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  28.85 
 
 
666 aa  179  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3040  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.63 
 
 
607 aa  179  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.636426 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0946  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.12 
 
 
666 aa  179  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1034  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.85 
 
 
666 aa  178  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000960134  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  31.29 
 
 
677 aa  178  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  25.16 
 
 
1332 aa  178  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.71 
 
 
666 aa  178  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  27.72 
 
 
610 aa  177  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.93 
 
 
666 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  29.14 
 
 
592 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  27.59 
 
 
587 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  28.83 
 
 
622 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  28.33 
 
 
622 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  28.97 
 
 
625 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  29.37 
 
 
600 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  28.62 
 
 
606 aa  175  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  26.05 
 
 
582 aa  174  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  29.11 
 
 
733 aa  174  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1108  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.23 
 
 
592 aa  174  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.689619  hitchhiker  0.00000403597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  27.1 
 
 
631 aa  172  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  28.1 
 
 
666 aa  172  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0501  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.15 
 
 
593 aa  172  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.300682  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.66 
 
 
597 aa  172  5e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf684  ABC-type multidrug transport system  27.19 
 
 
617 aa  172  5e-41  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  28.29 
 
 
620 aa  172  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  25.62 
 
 
1218 aa  171  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  28.41 
 
 
617 aa  171  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0520  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.96 
 
 
593 aa  171  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0504  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.96 
 
 
593 aa  171  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0564  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.96 
 
 
593 aa  171  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550146  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0510  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.96 
 
 
593 aa  171  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.991791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  27.43 
 
 
631 aa  171  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  28.43 
 
 
594 aa  171  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  28.6 
 
 
666 aa  170  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>