More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0564 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00401  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  88.03 
 
 
593 aa  1040    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3160  ABC transporter related protein  88.03 
 
 
593 aa  1039    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  72.97 
 
 
591 aa  875    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  72.54 
 
 
597 aa  845    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0537  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  88.03 
 
 
593 aa  1039    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0492  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  87.52 
 
 
593 aa  1034    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3040  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  78.71 
 
 
607 aa  893    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.636426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0564  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  100 
 
 
593 aa  1188    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550146  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3221  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  78.88 
 
 
607 aa  895    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1108  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  79.93 
 
 
592 aa  933    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.689619  hitchhiker  0.00000403597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0520  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  100 
 
 
593 aa  1188    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00405  hypothetical protein  88.03 
 
 
593 aa  1040    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3166  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  88.03 
 
 
593 aa  1039    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0510  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  100 
 
 
593 aa  1188    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.991791 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0485  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  88.03 
 
 
593 aa  1040    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3252  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  72.06 
 
 
601 aa  879    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3079  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  78.88 
 
 
607 aa  895    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0501  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  99.66 
 
 
593 aa  1186    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.300682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2866  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  73.46 
 
 
594 aa  834    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.749426  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0526  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  88.03 
 
 
593 aa  1039    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0917  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  85.67 
 
 
593 aa  1034    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0504  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  99.66 
 
 
593 aa  1187    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  49.29 
 
 
592 aa  521  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003565  putative ATP-binding component of a transport system  48.53 
 
 
591 aa  500  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  41.81 
 
 
592 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  38.61 
 
 
594 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  41.28 
 
 
606 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  38.24 
 
 
587 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  38.18 
 
 
587 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  37.8 
 
 
587 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.63 
 
 
587 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  37.63 
 
 
587 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  37.63 
 
 
587 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.63 
 
 
587 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  37.63 
 
 
587 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.63 
 
 
587 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.63 
 
 
587 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  37.98 
 
 
587 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.43 
 
 
579 aa  366  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.61 
 
 
581 aa  352  1e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0943  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.35 
 
 
666 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.54 
 
 
666 aa  352  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0946  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.35 
 
 
666 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.73 
 
 
666 aa  351  3e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.35 
 
 
666 aa  350  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1034  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.35 
 
 
666 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000960134  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  41.08 
 
 
677 aa  349  7e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  37.31 
 
 
666 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0752  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.35 
 
 
666 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  33.78 
 
 
622 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0758  ABC transporter related  36.35 
 
 
666 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.621384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  32.81 
 
 
600 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  31.53 
 
 
578 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  33.51 
 
 
594 aa  317  5e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.27 
 
 
604 aa  315  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  30.74 
 
 
599 aa  314  3.9999999999999997e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.94 
 
 
597 aa  313  7.999999999999999e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  33.28 
 
 
602 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  34.01 
 
 
611 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  31.12 
 
 
588 aa  309  9e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  35.18 
 
 
592 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.93 
 
 
599 aa  307  4.0000000000000004e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  34.47 
 
 
588 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  34.86 
 
 
650 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  33.1 
 
 
589 aa  299  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  33.27 
 
 
592 aa  296  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1391  ABC transporter permease  32.2 
 
 
594 aa  295  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  33.84 
 
 
610 aa  295  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  32.93 
 
 
608 aa  294  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  33.17 
 
 
625 aa  293  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  35.15 
 
 
608 aa  292  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  32.93 
 
 
585 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  34.35 
 
 
600 aa  290  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  33.28 
 
 
603 aa  289  8e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  30.67 
 
 
680 aa  289  9e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  29.93 
 
 
598 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  34.3 
 
 
607 aa  286  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  30.51 
 
 
645 aa  285  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  34.85 
 
 
641 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  32.39 
 
 
611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  29.36 
 
 
626 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.48 
 
 
614 aa  283  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.36 
 
 
590 aa  283  7.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  32.15 
 
 
603 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.99 
 
 
578 aa  281  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  32.54 
 
 
602 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  32.87 
 
 
617 aa  281  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  35.25 
 
 
631 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.99 
 
 
578 aa  280  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.99 
 
 
578 aa  280  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  32.06 
 
 
611 aa  280  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.82 
 
 
618 aa  280  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  31.2 
 
 
627 aa  280  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  29.42 
 
 
602 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  33.64 
 
 
623 aa  278  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  29.82 
 
 
618 aa  279  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2809  ABC transporter related protein  31.86 
 
 
685 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000401282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3822  ABC transporter transmembrane region  33.68 
 
 
605 aa  279  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568746  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  32.68 
 
 
675 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.22 
 
 
597 aa  278  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>