More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_77740 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  38.52 
 
 		 1396 aa  966    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  32.12 
 
 		 1535 aa  684    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  100 
 
 		 1423 aa  2934    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  37.6 
 
 		 1513 aa  879    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  51.31 
 
 		 1367 aa  1461    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  64.85 
 
 		 1458 aa  1924    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  52.66 
 
 		 1381 aa  1434    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  32.19 
 
 		 1549 aa  671    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  29.53 
 
 		 1667 aa  624  1e-177  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  32.38 
 
 		 1135 aa  623  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  31.11 
 
 		 1507 aa  620  1e-176  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  30.3 
 
 		 1587 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  37.98 
 
 		 1317 aa  603  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  31.92 
 
 		 1157 aa  585  1.0000000000000001e-165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  35.96 
 
 		 1256 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  29.51 
 
 		 1549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  30.32 
 
 		 1573 aa  570  1e-161  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  30.34 
 
 		 1168 aa  570  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  29.58 
 
 		 1636 aa  567  1e-160  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  28.57 
 
 		 1640 aa  553  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.16 
 
 		 1623 aa  515  1e-144  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.58 
 
 		 1705 aa  502  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  28.07 
 
 		 1416 aa  502  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  30.48 
 
 		 1611 aa  495  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  28.36 
 
 		 1514 aa  493  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.09 
 
 		 1456 aa  491  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  29.13 
 
 		 1127 aa  474  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.89 
 
 		 1659 aa  474  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  34.29 
 
 		 1248 aa  466  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  28.27 
 
 		 1351 aa  426  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  31.14 
 
 		 1557 aa  420  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  27.97 
 
 		 1463 aa  411  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  28.09 
 
 		 1607 aa  401  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.64 
 
 		 1115 aa  377  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  24.72 
 
 		 1511 aa  356  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  27.31 
 
 		 1562 aa  346  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  32.66 
 
 		 1669 aa  345  5e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  29.21 
 
 		 1773 aa  217  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  29.79 
 
 		 594 aa  202  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  28.39 
 
 		 622 aa  198  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  30.36 
 
 		 589 aa  197  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.42 
 
 		 581 aa  197  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  29.28 
 
 		 592 aa  196  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  28.83 
 
 		 587 aa  196  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  28.52 
 
 		 587 aa  195  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  29.37 
 
 		 587 aa  196  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  28.52 
 
 		 587 aa  195  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  28.52 
 
 		 587 aa  195  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.52 
 
 		 587 aa  195  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.52 
 
 		 587 aa  195  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.02 
 
 		 597 aa  194  9e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  29.45 
 
 		 594 aa  194  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.16 
 
 		 587 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  28.47 
 
 		 587 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.32 
 
 		 589 aa  192  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.11 
 
 		 587 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  32.44 
 
 		 677 aa  187  9e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0921  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.64 
 
 		 579 aa  187  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.451099  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  24.41 
 
 		 1194 aa  187  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.14 
 
 		 641 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  27.23 
 
 		 600 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.39 
 
 		 597 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  29.04 
 
 		 625 aa  187  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  23.62 
 
 		 1284 aa  185  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  29.98 
 
 		 590 aa  186  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  28.11 
 
 		 587 aa  186  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  30.65 
 
 		 592 aa  185  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  25.95 
 
 		 606 aa  185  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.86 
 
 		 579 aa  185  6e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  28.94 
 
 		 594 aa  184  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03608  ABC transporter protein AtrC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y748]  23.88 
 
 		 1266 aa  184  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  30.06 
 
 		 642 aa  184  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  27.16 
 
 		 592 aa  184  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  27.41 
 
 		 600 aa  183  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  29.81 
 
 		 600 aa  183  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  28.15 
 
 		 592 aa  183  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.59 
 
 		 595 aa  184  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  27.54 
 
 		 695 aa  183  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  28.68 
 
 		 594 aa  183  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  29.62 
 
 		 663 aa  182  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  28.68 
 
 		 980 aa  181  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  29.25 
 
 		 617 aa  182  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  22.64 
 
 		 1264 aa  181  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.27 
 
 		 597 aa  181  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  30.38 
 
 		 611 aa  181  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  27.77 
 
 		 669 aa  181  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  29.86 
 
 		 666 aa  181  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  26.75 
 
 		 613 aa  180  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.34 
 
 		 632 aa  181  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  29.62 
 
 		 666 aa  181  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  29.82 
 
 		 607 aa  179  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.25 
 
 		 628 aa  179  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  28.83 
 
 		 606 aa  179  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  25.16 
 
 		 617 aa  180  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.9 
 
 		 637 aa  179  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1391  ABC transporter permease  28.36 
 
 		 594 aa  179  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  27.46 
 
 		 634 aa  179  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.24 
 
 		 666 aa  178  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  27.47 
 
 		 607 aa  179  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  27.29 
 
 		 971 aa  178  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>