More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_69625 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  31.78 
 
 		 1396 aa  709    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  32.77 
 
 		 1514 aa  656    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  31.29 
 
 		 1535 aa  675    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  31.95 
 
 		 1611 aa  696    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  42.72 
 
 		 1667 aa  1277    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  33.08 
 
 		 1317 aa  668    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  35.2 
 
 		 1669 aa  872    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.52 
 
 		 1623 aa  694    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  30.77 
 
 		 1587 aa  659    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  36.17 
 
 		 1705 aa  890    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  100 
 
 		 1636 aa  3361    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  32.15 
 
 		 1168 aa  651    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  31.38 
 
 		 1549 aa  672    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  36.46 
 
 		 1135 aa  707    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  34.11 
 
 		 1157 aa  624  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  31.02 
 
 		 1549 aa  616  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  29.58 
 
 		 1256 aa  611  1e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  37.3 
 
 		 1513 aa  598  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  29.56 
 
 		 1640 aa  598  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  29.2 
 
 		 1573 aa  592  1e-167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  29.41 
 
 		 1463 aa  574  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  30.96 
 
 		 1507 aa  568  1e-160  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  30.67 
 
 		 1607 aa  567  1e-160  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  28.35 
 
 		 1416 aa  553  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  29.94 
 
 		 1367 aa  540  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  33.75 
 
 		 1458 aa  529  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  33.03 
 
 		 1423 aa  525  1e-147  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  31.39 
 
 		 1381 aa  525  1e-147  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  29.26 
 
 		 1127 aa  502  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  29.48 
 
 		 1248 aa  490  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  29.68 
 
 		 1562 aa  477  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.83 
 
 		 1456 aa  469  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  42.56 
 
 		 1659 aa  423  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  36.03 
 
 		 1351 aa  335  5e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  31.68 
 
 		 1557 aa  292  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  32.15 
 
 		 1115 aa  270  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.49 
 
 		 1773 aa  249  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.87117 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  26.12 
 
 		 1511 aa  232  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  29.52 
 
 		 634 aa  212  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  29.23 
 
 		 669 aa  212  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  29.84 
 
 		 582 aa  208  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.86 
 
 		 597 aa  204  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  30.37 
 
 		 600 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  27.22 
 
 		 596 aa  201  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  30.47 
 
 		 594 aa  201  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  28.87 
 
 		 672 aa  199  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.86 
 
 		 604 aa  198  8.000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  29.71 
 
 		 584 aa  197  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  28.3 
 
 		 622 aa  196  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.4 
 
 		 721 aa  196  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  27.8 
 
 		 665 aa  196  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  27.77 
 
 		 600 aa  193  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.73 
 
 		 589 aa  194  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  30.08 
 
 		 592 aa  194  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.84 
 
 		 1001 aa  193  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  27.84 
 
 		 671 aa  192  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.94 
 
 		 1003 aa  192  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  27.85 
 
 		 695 aa  192  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  27.17 
 
 		 631 aa  192  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  27.17 
 
 		 631 aa  192  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.71 
 
 		 579 aa  191  8e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.63 
 
 		 581 aa  191  9e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  27.79 
 
 		 602 aa  191  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.35 
 
 		 580 aa  190  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  26.97 
 
 		 631 aa  190  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  27.72 
 
 		 666 aa  190  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  27.54 
 
 		 663 aa  190  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0921  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.19 
 
 		 579 aa  189  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.451099  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  28.96 
 
 		 575 aa  189  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  28.75 
 
 		 672 aa  189  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  28.49 
 
 		 811 aa  189  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  29.6 
 
 		 598 aa  189  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  28.79 
 
 		 608 aa  188  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.81 
 
 		 1008 aa  188  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  27.88 
 
 		 663 aa  188  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  28.99 
 
 		 613 aa  188  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.81 
 
 		 1008 aa  188  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  29.61 
 
 		 652 aa  188  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  28.15 
 
 		 733 aa  188  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  29.96 
 
 		 592 aa  188  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  28.69 
 
 		 607 aa  188  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  28.35 
 
 		 567 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  28.35 
 
 		 567 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  27.57 
 
 		 765 aa  188  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  28.84 
 
 		 613 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.32 
 
 		 971 aa  187  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.24 
 
 		 597 aa  187  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.9 
 
 		 609 aa  186  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  27.57 
 
 		 600 aa  186  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  29.06 
 
 		 614 aa  186  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  28.57 
 
 		 610 aa  186  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  27.85 
 
 		 592 aa  186  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  27.92 
 
 		 680 aa  186  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  28.95 
 
 		 653 aa  185  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  27.98 
 
 		 610 aa  185  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  27.29 
 
 		 741 aa  185  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  27.98 
 
 		 610 aa  185  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0822  ABC transporter related  28.41 
 
 		 640 aa  185  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0882213  hitchhiker  0.0000266707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  28.43 
 
 		 691 aa  185  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.32 
 
 		 1000 aa  185  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>