More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00900 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  32.1 
 
 		 1667 aa  683    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  33.08 
 
 		 1669 aa  655    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  100 
 
 		 1623 aa  3323    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  34.9 
 
 		 1636 aa  687    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  33.86 
 
 		 1135 aa  601  1e-170  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.77 
 
 		 1705 aa  592  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  32.11 
 
 		 1535 aa  550  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  33.6 
 
 		 1157 aa  553  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  31.94 
 
 		 1611 aa  548  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  32.48 
 
 		 1396 aa  546  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  31.92 
 
 		 1549 aa  537  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  31.91 
 
 		 1256 aa  530  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  31.76 
 
 		 1514 aa  528  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  32.05 
 
 		 1607 aa  529  1e-148  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  31.74 
 
 		 1317 aa  523  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  30.6 
 
 		 1367 aa  514  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.68 
 
 		 1659 aa  511  1e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  30.34 
 
 		 1423 aa  504  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  30.92 
 
 		 1168 aa  493  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  30.78 
 
 		 1573 aa  488  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  30.58 
 
 		 1463 aa  485  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  30.35 
 
 		 1640 aa  486  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  28.69 
 
 		 1549 aa  474  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  35.66 
 
 		 1513 aa  474  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  31.17 
 
 		 1507 aa  468  9.999999999999999e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  31.26 
 
 		 1381 aa  463  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  32.42 
 
 		 1458 aa  455  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  31.14 
 
 		 1248 aa  450  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  29.27 
 
 		 1127 aa  440  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  27.99 
 
 		 1416 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  28.88 
 
 		 1557 aa  420  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  29.26 
 
 		 1456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  29.61 
 
 		 1562 aa  399  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.99 
 
 		 1115 aa  367  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  26.47 
 
 		 1511 aa  332  3e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  34.33 
 
 		 1587 aa  325  4e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  32.32 
 
 		 1351 aa  317  9.999999999999999e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  29.61 
 
 		 1773 aa  211  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  29.21 
 
 		 602 aa  198  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.66 
 
 		 589 aa  188  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.82 
 
 		 1000 aa  182  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  31.66 
 
 		 598 aa  180  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  28.9 
 
 		 597 aa  179  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.57 
 
 		 579 aa  179  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  28.42 
 
 		 582 aa  179  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  30.22 
 
 		 582 aa  177  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  29.13 
 
 		 596 aa  176  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  29.61 
 
 		 592 aa  175  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  24.32 
 
 		 1284 aa  174  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09342  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.56 
 
 		 1323 aa  173  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  32.99 
 
 		 726 aa  174  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  26.53 
 
 		 600 aa  172  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.17 
 
 		 608 aa  172  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  27.06 
 
 		 975 aa  172  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  28.07 
 
 		 598 aa  172  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.29 
 
 		 1006 aa  172  6e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  28.89 
 
 		 590 aa  171  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  28.2 
 
 		 671 aa  169  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  28.54 
 
 		 700 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  28.7 
 
 		 598 aa  169  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0921  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.57 
 
 		 579 aa  169  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.451099  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  29.61 
 
 		 622 aa  169  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.01 
 
 		 581 aa  168  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  30.04 
 
 		 592 aa  168  9e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  28.17 
 
 		 610 aa  167  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  28.16 
 
 		 575 aa  167  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0504  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.24 
 
 		 593 aa  168  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  29.86 
 
 		 619 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0564  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.05 
 
 		 593 aa  167  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0501  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.05 
 
 		 593 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.300682  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0510  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.05 
 
 		 593 aa  167  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.991791 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0520  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.05 
 
 		 593 aa  167  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  26.39 
 
 		 980 aa  166  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  28.7 
 
 		 598 aa  166  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.29 
 
 		 1003 aa  166  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  29.51 
 
 		 609 aa  166  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  28.17 
 
 		 610 aa  166  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  28.17 
 
 		 610 aa  166  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.93 
 
 		 604 aa  166  4.0000000000000004e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  28.07 
 
 		 614 aa  166  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  28.81 
 
 		 609 aa  165  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.42 
 
 		 641 aa  165  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  30.32 
 
 		 608 aa  165  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  28.25 
 
 		 590 aa  165  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.25 
 
 		 632 aa  165  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05641  putative multidrug efflux ABC transporter  29.38 
 
 		 599 aa  164  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  28.88 
 
 		 598 aa  164  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  29.51 
 
 		 603 aa  164  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.72 
 
 		 586 aa  164  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  27.24 
 
 		 734 aa  164  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  27.52 
 
 		 596 aa  164  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  28.89 
 
 		 811 aa  164  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  27.2 
 
 		 617 aa  163  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  30.35 
 
 		 625 aa  163  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08241  putative multidrug efflux ABC transporter  27.95 
 
 		 598 aa  164  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  27.52 
 
 		 596 aa  163  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  29.57 
 
 		 725 aa  163  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  24.3 
 
 		 599 aa  163  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  29.04 
 
 		 724 aa  163  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003565  putative ATP-binding component of a transport system  30.43 
 
 		 591 aa  163  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>