More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60398 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  100 
 
 		 1367 aa  2822    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.96 
 
 		 1396 aa  931    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  32.13 
 
 		 1535 aa  664    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  35.14 
 
 		 1513 aa  797    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  50.95 
 
 		 1423 aa  1416    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  32.29 
 
 		 1549 aa  641    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  31.4 
 
 		 1317 aa  648    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  48.31 
 
 		 1458 aa  1379    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  45.11 
 
 		 1381 aa  1174    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  31.55 
 
 		 1256 aa  611  1e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  29.52 
 
 		 1667 aa  595  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  30.96 
 
 		 1587 aa  596  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  32.32 
 
 		 1157 aa  590  1e-167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  31.1 
 
 		 1168 aa  584  1.0000000000000001e-165  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  31.72 
 
 		 1135 aa  579  1.0000000000000001e-163  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  31.05 
 
 		 1549 aa  570  1e-161  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  31.01 
 
 		 1573 aa  563  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  29.76 
 
 		 1507 aa  562  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  29.43 
 
 		 1640 aa  558  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  30.21 
 
 		 1636 aa  545  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.78 
 
 		 1623 aa  512  1e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  29.94 
 
 		 1248 aa  511  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.13 
 
 		 1669 aa  490  1e-137  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  28.36 
 
 		 1416 aa  491  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  29.18 
 
 		 1456 aa  481  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.37 
 
 		 1705 aa  482  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.04 
 
 		 1659 aa  479  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  29.81 
 
 		 1127 aa  475  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  27.23 
 
 		 1557 aa  458  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  28.43 
 
 		 1514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  31.85 
 
 		 1611 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  27.41 
 
 		 1351 aa  432  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  29.63 
 
 		 1607 aa  418  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  26.24 
 
 		 1463 aa  378  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.53 
 
 		 1115 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  27.16 
 
 		 1562 aa  350  8e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  24.02 
 
 		 1511 aa  320  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  24.48 
 
 		 1264 aa  232  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  29.32 
 
 		 1773 aa  226  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  30.94 
 
 		 594 aa  213  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  29.66 
 
 		 640 aa  205  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  29.45 
 
 		 594 aa  204  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  30.43 
 
 		 592 aa  202  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  30.14 
 
 		 666 aa  202  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  27.87 
 
 		 600 aa  198  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  28.31 
 
 		 631 aa  197  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  28.6 
 
 		 592 aa  197  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  29.25 
 
 		 594 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  27.84 
 
 		 613 aa  196  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  29.31 
 
 		 669 aa  195  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  28.55 
 
 		 636 aa  195  5e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  27.5 
 
 		 672 aa  194  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  29.75 
 
 		 611 aa  194  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  28.21 
 
 		 622 aa  194  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.68 
 
 		 637 aa  194  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.58 
 
 		 603 aa  193  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  27.92 
 
 		 623 aa  192  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.04 
 
 		 637 aa  192  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  28.09 
 
 		 600 aa  192  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.76 
 
 		 589 aa  192  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  27.45 
 
 		 971 aa  191  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  28.36 
 
 		 612 aa  190  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  29.07 
 
 		 587 aa  190  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  28.05 
 
 		 587 aa  189  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  29.07 
 
 		 606 aa  190  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  29.81 
 
 		 599 aa  189  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  28.04 
 
 		 680 aa  189  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  27.73 
 
 		 600 aa  189  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  28.91 
 
 		 587 aa  189  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  28.91 
 
 		 587 aa  189  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  28.91 
 
 		 587 aa  189  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  28.31 
 
 		 671 aa  189  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.91 
 
 		 587 aa  189  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.91 
 
 		 587 aa  189  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  27.44 
 
 		 628 aa  189  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  28.04 
 
 		 665 aa  188  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  26.43 
 
 		 594 aa  188  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  27.13 
 
 		 590 aa  188  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  26.63 
 
 		 588 aa  187  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  28.65 
 
 		 642 aa  187  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  29.57 
 
 		 666 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  26.3 
 
 		 625 aa  187  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  28.71 
 
 		 649 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  28.97 
 
 		 695 aa  186  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.95 
 
 		 606 aa  186  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09342  ABC multidrug transporter (Eurofung)  23.8 
 
 		 1323 aa  186  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.46 
 
 		 641 aa  185  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.65 
 
 		 587 aa  185  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.65 
 
 		 587 aa  185  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  28.71 
 
 		 672 aa  185  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  25.59 
 
 		 602 aa  185  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.51 
 
 		 583 aa  185  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  27.68 
 
 		 675 aa  185  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  29.29 
 
 		 691 aa  184  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  28.26 
 
 		 607 aa  184  9.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.79 
 
 		 597 aa  184  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  27.74 
 
 		 587 aa  184  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.64 
 
 		 639 aa  184  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.42 
 
 		 677 aa  184  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  27.65 
 
 		 578 aa  184  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>