More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00080 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  100 
 
 
1607 aa  3331    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.9 
 
 
1659 aa  619  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  31.14 
 
 
1514 aa  557  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866258 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  30.35 
 
 
1636 aa  556  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0930816 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  30.09 
 
 
1667 aa  550  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  32.05 
 
 
1623 aa  521  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.24 
 
 
1705 aa  515  1e-144  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  28.41 
 
 
1669 aa  492  1e-137  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  29.77 
 
 
1157 aa  473  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.86553 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  31.18 
 
 
1611 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.576912 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  29.59 
 
 
1562 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  30.61 
 
 
1135 aa  456  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  29.11 
 
 
1587 aa  453  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.55 
 
 
1396 aa  449  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  28.5 
 
 
1317 aa  431  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  27.98 
 
 
1256 aa  424  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  32.12 
 
 
1513 aa  417  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  28.8 
 
 
1168 aa  418  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  28.9 
 
 
1549 aa  412  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  29.46 
 
 
1367 aa  411  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  28.69 
 
 
1381 aa  410  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  28.89 
 
 
1535 aa  407  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  29.48 
 
 
1127 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  28.13 
 
 
1573 aa  395  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  28.03 
 
 
1640 aa  393  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  27.17 
 
 
1507 aa  391  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  28.81 
 
 
1416 aa  382  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  26.63 
 
 
1463 aa  379  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  29.2 
 
 
1458 aa  378  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  30.57 
 
 
1423 aa  372  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  27.43 
 
 
1248 aa  360  1.9999999999999998e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.19 
 
 
1456 aa  351  6e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  28.48 
 
 
1557 aa  338  5e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  25.96 
 
 
1115 aa  281  8e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  27.34 
 
 
1511 aa  276  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  31.39 
 
 
1549 aa  272  4e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  30.5 
 
 
1351 aa  229  5.0000000000000005e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.95 
 
 
1773 aa  187  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  28.63 
 
 
672 aa  186  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  28.34 
 
 
620 aa  181  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.64 
 
 
597 aa  179  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.64 
 
 
597 aa  179  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  28.91 
 
 
671 aa  175  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  28.63 
 
 
587 aa  175  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  28.44 
 
 
587 aa  174  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  29.95 
 
 
606 aa  172  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  28.24 
 
 
587 aa  172  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.24 
 
 
587 aa  172  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  28.3 
 
 
587 aa  171  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.24 
 
 
587 aa  172  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  28.82 
 
 
587 aa  171  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.05 
 
 
587 aa  171  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  28.02 
 
 
579 aa  171  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  28.62 
 
 
600 aa  171  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.92 
 
 
587 aa  171  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  29.47 
 
 
607 aa  170  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  29.01 
 
 
587 aa  170  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  28.07 
 
 
617 aa  170  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  26.12 
 
 
596 aa  170  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  33.25 
 
 
603 aa  170  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  28.87 
 
 
582 aa  169  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.94 
 
 
613 aa  169  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  28.16 
 
 
587 aa  169  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  27.76 
 
 
592 aa  168  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.19 
 
 
577 aa  168  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  25.06 
 
 
1218 aa  168  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  28.92 
 
 
600 aa  169  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  26.73 
 
 
669 aa  168  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  31.79 
 
 
603 aa  168  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.64 
 
 
597 aa  167  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  32.35 
 
 
636 aa  167  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  29.13 
 
 
593 aa  167  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  28.66 
 
 
622 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.06 
 
 
579 aa  166  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.21 
 
 
600 aa  166  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  28.12 
 
 
608 aa  166  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  23.87 
 
 
1218 aa  166  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  27.83 
 
 
700 aa  165  7e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  27.22 
 
 
598 aa  165  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.1 
 
 
865 aa  165  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  35.48 
 
 
592 aa  164  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0690  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  26.21 
 
 
581 aa  164  1e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.212037  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.94 
 
 
1018 aa  164  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  28.28 
 
 
586 aa  163  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  35.05 
 
 
597 aa  163  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  28.38 
 
 
601 aa  163  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.18 
 
 
721 aa  163  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  30.98 
 
 
585 aa  163  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  36 
 
 
614 aa  163  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.39 
 
 
584 aa  163  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  27.55 
 
 
628 aa  163  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  33.68 
 
 
1003 aa  163  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  28.95 
 
 
653 aa  163  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  30.45 
 
 
594 aa  163  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  27.35 
 
 
594 aa  162  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  26.88 
 
 
582 aa  162  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.74 
 
 
603 aa  162  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  31.44 
 
 
600 aa  162  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.65 
 
 
584 aa  162  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  35.23 
 
 
575 aa  162  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>