More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_70510 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  33.94 
 
 		 1396 aa  753    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  51.38 
 
 		 1535 aa  1505    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  32.01 
 
 		 1667 aa  711    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  39.38 
 
 		 1573 aa  1011    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  46.6 
 
 		 1587 aa  1194    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  35.48 
 
 		 1256 aa  742    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  31.18 
 
 		 1636 aa  694    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  41.46 
 
 		 1640 aa  1050    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  48.37 
 
 		 1157 aa  1096    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  34.88 
 
 		 1317 aa  786    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  32.25 
 
 		 1367 aa  648    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  39.47 
 
 		 1549 aa  1056    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  38.56 
 
 		 1168 aa  772    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  100 
 
 		 1549 aa  3175    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  32.17 
 
 		 1423 aa  669    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  35.74 
 
 		 1135 aa  721    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.42 
 
 		 1669 aa  622  1e-176  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  31.83 
 
 		 1381 aa  604  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  38.84 
 
 		 1513 aa  597  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  30.97 
 
 		 1507 aa  580  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  31.62 
 
 		 1248 aa  572  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.04 
 
 		 1659 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.15 
 
 		 1705 aa  558  1e-157  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  31.73 
 
 		 1127 aa  546  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  36.8 
 
 		 1458 aa  543  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  32.55 
 
 		 1351 aa  546  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  31.13 
 
 		 1514 aa  539  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  30.77 
 
 		 1611 aa  521  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  29.68 
 
 		 1456 aa  498  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  26.88 
 
 		 1557 aa  485  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  28.26 
 
 		 1463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  27.96 
 
 		 1607 aa  434  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.29 
 
 		 1115 aa  425  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  25.63 
 
 		 1562 aa  375  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  36.47 
 
 		 1623 aa  354  8.999999999999999e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  34.62 
 
 		 1416 aa  338  3.9999999999999995e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  28.41 
 
 		 1511 aa  243  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.79 
 
 		 1773 aa  213  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  32.16 
 
 		 622 aa  212  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  30.77 
 
 		 592 aa  210  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  30.32 
 
 		 592 aa  209  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  30.51 
 
 		 610 aa  206  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  28.92 
 
 		 592 aa  202  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.29 
 
 		 597 aa  196  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  31.29 
 
 		 597 aa  197  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  28.05 
 
 		 811 aa  196  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  31.13 
 
 		 592 aa  195  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  29.22 
 
 		 600 aa  195  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.37 
 
 		 603 aa  194  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  31.95 
 
 		 626 aa  194  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.07 
 
 		 589 aa  193  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  28.16 
 
 		 765 aa  194  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  30.16 
 
 		 626 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  28.26 
 
 		 592 aa  192  4e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.44 
 
 		 589 aa  192  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.75 
 
 		 597 aa  192  4e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  29.23 
 
 		 598 aa  191  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  30.12 
 
 		 610 aa  191  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  27.05 
 
 		 669 aa  191  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.09 
 
 		 597 aa  191  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  30.12 
 
 		 610 aa  191  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  27.94 
 
 		 582 aa  191  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.11 
 
 		 595 aa  191  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.69 
 
 		 619 aa  190  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  28.6 
 
 		 602 aa  190  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  29.57 
 
 		 598 aa  190  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  30.06 
 
 		 608 aa  189  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003565  putative ATP-binding component of a transport system  28.54 
 
 		 591 aa  188  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  25.45 
 
 		 663 aa  188  8e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  27.82 
 
 		 611 aa  187  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  28.43 
 
 		 661 aa  187  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.54 
 
 		 579 aa  187  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  27.27 
 
 		 666 aa  187  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  28.54 
 
 		 594 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  31.4 
 
 		 575 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.15 
 
 		 971 aa  186  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  27.04 
 
 		 575 aa  186  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  29.48 
 
 		 594 aa  185  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  27.47 
 
 		 672 aa  186  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf684  ABC-type multidrug transport system  28.65 
 
 		 617 aa  185  6e-45  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  28.08 
 
 		 593 aa  185  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  29.52 
 
 		 587 aa  184  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  28.06 
 
 		 600 aa  184  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00401  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  27.24 
 
 		 593 aa  184  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3160  ABC transporter related protein  27.24 
 
 		 593 aa  184  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0485  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.24 
 
 		 593 aa  184  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  29.52 
 
 		 587 aa  184  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00405  hypothetical protein  27.24 
 
 		 593 aa  184  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.52 
 
 		 587 aa  184  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  26.34 
 
 		 634 aa  183  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0526  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.24 
 
 		 593 aa  184  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3166  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.24 
 
 		 593 aa  184  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  27.72 
 
 		 706 aa  183  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.52 
 
 		 587 aa  184  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  25.04 
 
 		 680 aa  183  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.76 
 
 		 583 aa  184  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0537  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.24 
 
 		 593 aa  184  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  28.08 
 
 		 614 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  27.54 
 
 		 584 aa  183  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  29.58 
 
 		 675 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>