More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_18197 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  35.37 
 
 
1396 aa  720    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  37.91 
 
 
1535 aa  772    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  35.01 
 
 
1157 aa  660    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  37.9 
 
 
1317 aa  740    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  100 
 
 
1168 aa  2383    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  35.69 
 
 
1256 aa  717    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  36.61 
 
 
1587 aa  744    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  38.3 
 
 
1549 aa  759    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  36.09 
 
 
1135 aa  686    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  33.44 
 
 
1549 aa  638    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  32.4 
 
 
1636 aa  652    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  32.24 
 
 
1640 aa  612  9.999999999999999e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  34.11 
 
 
1127 aa  612  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  31.88 
 
 
1667 aa  601  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  32.96 
 
 
1573 aa  595  1e-168  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  38.44 
 
 
1513 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  31.95 
 
 
1416 aa  584  1.0000000000000001e-165  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  31.1 
 
 
1367 aa  578  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  30.28 
 
 
1423 aa  553  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  32.02 
 
 
1248 aa  554  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  31.84 
 
 
1514 aa  537  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866258 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  31.67 
 
 
1507 aa  537  1e-151  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  31.28 
 
 
1611 aa  532  1e-149  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.576912 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  30.31 
 
 
1381 aa  529  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.94 
 
 
1705 aa  524  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  30.95 
 
 
1351 aa  511  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.92 
 
 
1623 aa  488  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  28.89 
 
 
1659 aa  483  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  33.3 
 
 
1458 aa  473  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  29.99 
 
 
1463 aa  463  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  30.28 
 
 
1557 aa  457  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.5 
 
 
1456 aa  417  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  28.8 
 
 
1607 aa  418  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.16 
 
 
1115 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  28.45 
 
 
1562 aa  373  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  26.59 
 
 
1511 aa  358  2.9999999999999997e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  35.99 
 
 
1669 aa  330  1.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  25.38 
 
 
1773 aa  302  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  30.47 
 
 
592 aa  196  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  28.83 
 
 
640 aa  192  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  29.59 
 
 
596 aa  189  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  28.17 
 
 
622 aa  187  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  29.41 
 
 
598 aa  187  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  28.81 
 
 
618 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  26.91 
 
 
1218 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  29.78 
 
 
596 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.47 
 
 
597 aa  186  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.47 
 
 
597 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.55 
 
 
618 aa  185  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  27.05 
 
 
582 aa  185  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  26.81 
 
 
1218 aa  184  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  25.98 
 
 
1194 aa  184  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  29.1 
 
 
646 aa  183  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  28.57 
 
 
669 aa  182  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  27.39 
 
 
622 aa  182  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.26 
 
 
586 aa  181  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  30.15 
 
 
608 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  28.47 
 
 
578 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  28.33 
 
 
590 aa  180  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  29.87 
 
 
610 aa  179  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  29.34 
 
 
592 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  28.97 
 
 
734 aa  179  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  30.6 
 
 
593 aa  179  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  29.68 
 
 
590 aa  178  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  30.85 
 
 
666 aa  179  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.5 
 
 
616 aa  178  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  28.35 
 
 
607 aa  179  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.37 
 
 
597 aa  179  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  28.81 
 
 
590 aa  179  4e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  27.57 
 
 
587 aa  178  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  26.64 
 
 
594 aa  177  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  27.08 
 
 
1218 aa  177  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  29.13 
 
 
642 aa  177  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.61 
 
 
573 aa  177  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  26.71 
 
 
1218 aa  177  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  27.45 
 
 
602 aa  177  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  28.54 
 
 
727 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.46 
 
 
971 aa  177  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  27.27 
 
 
599 aa  176  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  29.32 
 
 
611 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  26.8 
 
 
556 aa  177  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1108  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.41 
 
 
592 aa  176  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.689619  hitchhiker  0.00000403597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  28.57 
 
 
594 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  26.95 
 
 
582 aa  176  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  26.4 
 
 
575 aa  176  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  28.6 
 
 
734 aa  175  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  25.28 
 
 
1201 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.63 
 
 
589 aa  175  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.85 
 
 
604 aa  175  3.9999999999999995e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  26.79 
 
 
587 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  28.21 
 
 
594 aa  175  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  29.09 
 
 
672 aa  175  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  27.98 
 
 
634 aa  174  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  26.95 
 
 
631 aa  174  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  28.79 
 
 
606 aa  174  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  29.92 
 
 
677 aa  174  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  26.6 
 
 
1218 aa  174  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.02 
 
 
587 aa  173  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  29.1 
 
 
626 aa  173  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  28.02 
 
 
587 aa  173  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>