More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA08000 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.08 
 
 		 1396 aa  710    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  100 
 
 		 1507 aa  3109    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  32.92 
 
 		 1535 aa  615  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  31.86 
 
 		 1256 aa  595  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  30.82 
 
 		 1423 aa  594  1e-168  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  30.22 
 
 		 1317 aa  593  1e-168  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  31.27 
 
 		 1458 aa  585  1.0000000000000001e-165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  31.17 
 
 		 1636 aa  580  1e-164  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  31.11 
 
 		 1549 aa  579  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  31.87 
 
 		 1587 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  29.63 
 
 		 1367 aa  570  1e-161  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  32.17 
 
 		 1135 aa  570  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  32.15 
 
 		 1381 aa  564  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  39.22 
 
 		 1513 aa  560  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  32.89 
 
 		 1157 aa  559  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  31.67 
 
 		 1168 aa  548  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  30.28 
 
 		 1573 aa  530  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  29.73 
 
 		 1667 aa  524  1e-147  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  30.02 
 
 		 1640 aa  525  1e-147  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  27.68 
 
 		 1549 aa  503  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.8 
 
 		 1659 aa  498  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  30.67 
 
 		 1127 aa  473  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.86 
 
 		 1623 aa  468  9.999999999999999e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  30.15 
 
 		 1514 aa  458  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  28.54 
 
 		 1416 aa  444  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  28.76 
 
 		 1248 aa  442  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.19 
 
 		 1705 aa  428  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  27.31 
 
 		 1607 aa  397  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  28.06 
 
 		 1351 aa  396  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  28.83 
 
 		 1611 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.56 
 
 		 1456 aa  372  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  26.15 
 
 		 1557 aa  365  5.0000000000000005e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  25.09 
 
 		 1463 aa  354  8e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.85 
 
 		 1115 aa  327  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  25.49 
 
 		 1562 aa  325  6e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  25.79 
 
 		 1511 aa  311  5.9999999999999995e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.04 
 
 		 1669 aa  282  4e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  24.73 
 
 		 1332 aa  216  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.61 
 
 		 1773 aa  206  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  25.52 
 
 		 1264 aa  201  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  25.62 
 
 		 1284 aa  189  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.74 
 
 		 579 aa  187  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  28.8 
 
 		 600 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  28.31 
 
 		 600 aa  186  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  29.71 
 
 		 594 aa  182  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  26.4 
 
 		 1218 aa  182  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03608  ABC transporter protein AtrC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y748]  25.03 
 
 		 1266 aa  182  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  28.82 
 
 		 663 aa  181  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  29.91 
 
 		 695 aa  180  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.16 
 
 		 581 aa  180  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  26.57 
 
 		 1218 aa  179  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.12 
 
 		 597 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  28.37 
 
 		 597 aa  177  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  30.62 
 
 		 741 aa  176  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  26.2 
 
 		 1218 aa  175  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  24.16 
 
 		 1284 aa  174  7.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  26.15 
 
 		 588 aa  174  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  27.91 
 
 		 585 aa  173  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  25.67 
 
 		 1228 aa  173  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  28.86 
 
 		 742 aa  173  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  27.76 
 
 		 590 aa  172  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  25.75 
 
 		 1218 aa  172  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.47 
 
 		 589 aa  172  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  28.34 
 
 		 594 aa  172  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  28.3 
 
 		 611 aa  171  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.06 
 
 		 587 aa  171  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  28.11 
 
 		 607 aa  171  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0817  ABC transporter related  32.15 
 
 		 629 aa  170  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  28.31 
 
 		 593 aa  170  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  26.25 
 
 		 600 aa  170  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  26.21 
 
 		 1218 aa  170  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  37.45 
 
 		 609 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  28.43 
 
 		 592 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  28.69 
 
 		 669 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  27.98 
 
 		 602 aa  169  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  29.78 
 
 		 608 aa  169  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  28.57 
 
 		 614 aa  169  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  29.46 
 
 		 765 aa  168  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.23 
 
 		 597 aa  168  8e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.65 
 
 		 591 aa  168  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  27.84 
 
 		 590 aa  168  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  28.33 
 
 		 592 aa  168  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.65 
 
 		 609 aa  167  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  27.63 
 
 		 575 aa  167  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  26.77 
 
 		 650 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  25.91 
 
 		 620 aa  167  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  34.06 
 
 		 618 aa  167  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  28.2 
 
 		 640 aa  166  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  29.79 
 
 		 600 aa  166  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  27.48 
 
 		 590 aa  166  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1769  ABC transporter related  25.62 
 
 		 614 aa  166  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  26.2 
 
 		 622 aa  166  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3848  ABC transporter related  28.34 
 
 		 585 aa  166  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135668  normal  0.677159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  29.27 
 
 		 619 aa  166  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3126  ABC transporter related  29.61 
 
 		 592 aa  166  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  39.27 
 
 		 609 aa  165  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  27.46 
 
 		 594 aa  165  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  29.34 
 
 		 768 aa  165  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  25.58 
 
 		 870 aa  165  7e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  27.26 
 
 		 575 aa  165  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>