More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA07700 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  31.46 
 
 
1463 aa  657    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  34.75 
 
 
1667 aa  869    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  100 
 
 
1669 aa  3382    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  32.97 
 
 
1623 aa  642    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  35.56 
 
 
1705 aa  714    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  32.78 
 
 
1135 aa  643    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  35.2 
 
 
1636 aa  864    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0930816 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  29.95 
 
 
1396 aa  624  1e-177  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  28.98 
 
 
1549 aa  604  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  29.25 
 
 
1611 aa  598  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.576912 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  29.87 
 
 
1514 aa  575  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866258 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  30.06 
 
 
1549 aa  553  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  28.41 
 
 
1317 aa  523  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  28.41 
 
 
1607 aa  495  9.999999999999999e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  29.21 
 
 
1367 aa  489  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  28.52 
 
 
1416 aa  444  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  28.71 
 
 
1127 aa  436  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  37.37 
 
 
1513 aa  382  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.59 
 
 
1659 aa  355  4e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  33.22 
 
 
1458 aa  353  2e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  33.89 
 
 
1423 aa  350  1e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  34.69 
 
 
1535 aa  341  7e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  34.23 
 
 
1157 aa  333  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  36.05 
 
 
1168 aa  330  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  27.55 
 
 
1587 aa  321  6e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  34.19 
 
 
1381 aa  320  1e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  33.67 
 
 
1256 aa  309  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.07 
 
 
1456 aa  307  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  31.62 
 
 
1640 aa  302  3e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  32.61 
 
 
1573 aa  300  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  31.04 
 
 
1507 aa  276  3e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  32.92 
 
 
1562 aa  275  7e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  29.17 
 
 
1351 aa  249  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  30.52 
 
 
1557 aa  239  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185378 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  30.91 
 
 
1248 aa  239  4e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.22 
 
 
1773 aa  202  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.87117 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.15 
 
 
1115 aa  198  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  28.18 
 
 
1511 aa  180  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  27.68 
 
 
600 aa  163  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  28.3 
 
 
592 aa  160  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.39 
 
 
639 aa  157  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.18 
 
 
641 aa  157  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  27.95 
 
 
606 aa  157  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.38 
 
 
589 aa  157  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  25.12 
 
 
582 aa  156  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.67 
 
 
608 aa  155  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  28.12 
 
 
634 aa  154  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  27.13 
 
 
592 aa  154  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.37 
 
 
721 aa  154  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  25.59 
 
 
598 aa  152  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  24.65 
 
 
628 aa  151  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.92 
 
 
608 aa  150  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  25.8 
 
 
625 aa  150  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  27.63 
 
 
596 aa  150  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  26.49 
 
 
592 aa  149  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  26.01 
 
 
597 aa  149  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  26.01 
 
 
597 aa  149  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  28.47 
 
 
642 aa  149  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.8 
 
 
637 aa  148  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  26.89 
 
 
587 aa  148  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  27.8 
 
 
613 aa  148  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.61 
 
 
587 aa  147  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.54 
 
 
587 aa  147  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  26.61 
 
 
587 aa  147  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  26.61 
 
 
587 aa  147  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  26.61 
 
 
587 aa  147  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  26.14 
 
 
617 aa  147  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.61 
 
 
587 aa  147  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  25.89 
 
 
627 aa  147  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  27.29 
 
 
724 aa  147  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  25.79 
 
 
597 aa  146  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  27.07 
 
 
587 aa  146  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.21 
 
 
632 aa  146  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  27.29 
 
 
724 aa  147  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  26.85 
 
 
592 aa  146  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  27.3 
 
 
607 aa  146  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  26.75 
 
 
587 aa  145  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  23.58 
 
 
636 aa  145  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  25.58 
 
 
634 aa  145  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.36 
 
 
587 aa  145  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  26.84 
 
 
611 aa  145  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  25.68 
 
 
593 aa  144  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08241  putative multidrug efflux ABC transporter  26.25 
 
 
598 aa  144  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0690  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  23.22 
 
 
581 aa  144  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.212037  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  26.92 
 
 
598 aa  144  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  24.26 
 
 
613 aa  144  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0741  ABC transporter related protein  24.01 
 
 
650 aa  144  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.92 
 
 
583 aa  144  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  25.81 
 
 
603 aa  144  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  25.47 
 
 
741 aa  143  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.27 
 
 
637 aa  143  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  24.35 
 
 
609 aa  143  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  24.32 
 
 
675 aa  143  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  26.55 
 
 
611 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  26.87 
 
 
587 aa  142  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  25.17 
 
 
717 aa  142  7.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  25.26 
 
 
631 aa  141  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  26.26 
 
 
600 aa  142  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  26.67 
 
 
619 aa  141  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  26.18 
 
 
581 aa  141  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>