More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC05860 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  44.19 
 
 
1535 aa  1241    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  36.46 
 
 
1135 aa  725    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  31.08 
 
 
1636 aa  672    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  38.37 
 
 
1573 aa  839    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  36.77 
 
 
1168 aa  749    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  38.13 
 
 
1640 aa  869    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  100 
 
 
1587 aa  3250    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  46.66 
 
 
1549 aa  1195    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  34.23 
 
 
1317 aa  735    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  37.56 
 
 
1549 aa  873    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  40.11 
 
 
1157 aa  875    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  35.49 
 
 
1256 aa  761    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  30.16 
 
 
1423 aa  597  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  30.89 
 
 
1381 aa  586  1.0000000000000001e-165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  31.63 
 
 
1507 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  32.32 
 
 
1351 aa  573  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.8 
 
 
1705 aa  571  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  37.78 
 
 
1513 aa  551  1e-155  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  29.79 
 
 
1248 aa  545  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  31.48 
 
 
1127 aa  530  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.67 
 
 
1659 aa  524  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  34.2 
 
 
1458 aa  519  1.0000000000000001e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.6 
 
 
1456 aa  469  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  27.35 
 
 
1463 aa  459  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  31.15 
 
 
1611 aa  458  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.576912 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  28.8 
 
 
1607 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  27.56 
 
 
1557 aa  439  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  40.32 
 
 
1667 aa  419  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.03 
 
 
1396 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  34.87 
 
 
1367 aa  362  3e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  25.16 
 
 
1562 aa  353  1e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  37.93 
 
 
1416 aa  327  1e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  34.33 
 
 
1623 aa  326  2e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  27.77 
 
 
1669 aa  322  3.9999999999999996e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  31.99 
 
 
1514 aa  319  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866258 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  30.38 
 
 
1115 aa  236  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  27.9 
 
 
1511 aa  218  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  30 
 
 
663 aa  200  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  30.69 
 
 
594 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.77 
 
 
1773 aa  191  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  30.31 
 
 
614 aa  190  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  27.31 
 
 
613 aa  189  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  27.59 
 
 
600 aa  189  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  29.17 
 
 
640 aa  187  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  28.6 
 
 
741 aa  187  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  30.36 
 
 
622 aa  185  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  29.42 
 
 
594 aa  184  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  28.3 
 
 
669 aa  184  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  26.22 
 
 
592 aa  183  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.11 
 
 
581 aa  183  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  28.38 
 
 
671 aa  183  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.06 
 
 
589 aa  183  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  28.33 
 
 
634 aa  182  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  30.43 
 
 
608 aa  182  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  29.64 
 
 
666 aa  181  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  31.38 
 
 
677 aa  180  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0501  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.69 
 
 
593 aa  180  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.300682  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.68 
 
 
579 aa  179  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  26.1 
 
 
582 aa  179  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  28.75 
 
 
613 aa  179  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0510  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.48 
 
 
593 aa  178  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.991791 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0564  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.48 
 
 
593 aa  178  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550146  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0520  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.48 
 
 
593 aa  178  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0504  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  28.13 
 
 
593 aa  178  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  26.56 
 
 
742 aa  178  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  25.98 
 
 
610 aa  178  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  28.65 
 
 
587 aa  178  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  27.62 
 
 
556 aa  177  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  27.09 
 
 
587 aa  177  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.89 
 
 
585 aa  177  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  29.36 
 
 
573 aa  177  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  27.11 
 
 
587 aa  176  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  27.11 
 
 
587 aa  176  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  27.11 
 
 
587 aa  176  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.11 
 
 
587 aa  176  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.11 
 
 
587 aa  176  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  27.91 
 
 
646 aa  174  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  29.18 
 
 
592 aa  174  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3399  ABC transporter related  26.36 
 
 
614 aa  174  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  26.4 
 
 
588 aa  174  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  32.19 
 
 
581 aa  174  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  29.41 
 
 
592 aa  173  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  27.99 
 
 
599 aa  173  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  26.57 
 
 
587 aa  173  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1342  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.02 
 
 
588 aa  172  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  29.61 
 
 
594 aa  172  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.85 
 
 
586 aa  172  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  27.03 
 
 
586 aa  173  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  27.78 
 
 
593 aa  173  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.92 
 
 
587 aa  172  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.33 
 
 
721 aa  172  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  26.72 
 
 
587 aa  172  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1736  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.32 
 
 
616 aa  172  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.08 
 
 
599 aa  172  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  27.66 
 
 
631 aa  172  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.96 
 
 
586 aa  172  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  26.96 
 
 
603 aa  172  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.46 
 
 
639 aa  172  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.82 
 
 
587 aa  172  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  29.71 
 
 
606 aa  171  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>