More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01270 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  100 
 
 		 1562 aa  3204    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.31 
 
 		 1659 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  31.3 
 
 		 1636 aa  499  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  29.68 
 
 		 1607 aa  484  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.61 
 
 		 1623 aa  415  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  27.68 
 
 		 1157 aa  396  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  27.54 
 
 		 1256 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.23 
 
 		 1396 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  28.54 
 
 		 1168 aa  392  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  25.69 
 
 		 1549 aa  389  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  27.09 
 
 		 1317 aa  379  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  28.71 
 
 		 1135 aa  374  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  26.91 
 
 		 1367 aa  355  5e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  27.31 
 
 		 1423 aa  353  2e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  25.81 
 
 		 1507 aa  338  5e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  26.62 
 
 		 1127 aa  334  6e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  30.01 
 
 		 1513 aa  332  4e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  25.04 
 
 		 1587 aa  323  9.999999999999999e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  27.87 
 
 		 1458 aa  322  3.9999999999999996e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  27.03 
 
 		 1381 aa  318  4e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  25.46 
 
 		 1573 aa  318  7e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  26.59 
 
 		 1248 aa  309  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  32.92 
 
 		 1669 aa  303  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.58 
 
 		 1456 aa  295  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  32.97 
 
 		 1667 aa  251  7e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  27.53 
 
 		 1611 aa  251  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  29.51 
 
 		 1514 aa  243  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  31.78 
 
 		 1549 aa  226  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  31.1 
 
 		 1535 aa  223  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  32.44 
 
 		 1463 aa  223  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.91 
 
 		 1773 aa  220  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  28.84 
 
 		 1705 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  30.2 
 
 		 1416 aa  211  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  30.48 
 
 		 1640 aa  207  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  29.26 
 
 		 1351 aa  203  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  27.05 
 
 		 1557 aa  171  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2941  ABC transporter related  35.85 
 
 		 609 aa  162  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.417973  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2801  ABC transporter related  35.85 
 
 		 609 aa  162  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0386861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  35.61 
 
 		 666 aa  161  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.61 
 
 		 666 aa  161  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0758  ABC transporter related  35.36 
 
 		 666 aa  160  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.621384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1556  ABC transporter related  35.85 
 
 		 609 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00693987  normal  0.0222029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.74 
 
 		 666 aa  160  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0752  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  35.23 
 
 		 666 aa  160  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0943  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.23 
 
 		 666 aa  159  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0946  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.23 
 
 		 666 aa  160  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1034  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.23 
 
 		 666 aa  159  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000960134  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  35.47 
 
 		 609 aa  159  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  35.47 
 
 		 609 aa  159  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  34.98 
 
 		 666 aa  157  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0811  ABC transporter  35.23 
 
 		 246 aa  157  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.138813  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  33.45 
 
 		 593 aa  156  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.27 
 
 		 589 aa  156  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  34.89 
 
 		 734 aa  155  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  35.25 
 
 		 521 aa  155  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  34.47 
 
 		 609 aa  154  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  34.18 
 
 		 971 aa  153  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.33 
 
 		 597 aa  154  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  31.36 
 
 		 672 aa  154  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  35.47 
 
 		 609 aa  153  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  35.47 
 
 		 609 aa  153  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.11 
 
 		 604 aa  154  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08241  putative multidrug efflux ABC transporter  35.11 
 
 		 598 aa  153  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  29.8 
 
 		 1511 aa  153  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  34.53 
 
 		 734 aa  153  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  35.09 
 
 		 609 aa  153  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  33.02 
 
 		 652 aa  152  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  34.6 
 
 		 616 aa  152  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  30.93 
 
 		 612 aa  152  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  32.97 
 
 		 738 aa  152  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  32.7 
 
 		 622 aa  151  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.4 
 
 		 1001 aa  151  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  36.47 
 
 		 597 aa  151  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  34.85 
 
 		 609 aa  151  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  35.61 
 
 		 609 aa  151  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  35.74 
 
 		 598 aa  151  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  34.4 
 
 		 608 aa  151  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  32.98 
 
 		 634 aa  150  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  33.21 
 
 		 609 aa  150  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.09 
 
 		 599 aa  150  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  35.36 
 
 		 598 aa  149  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  37.14 
 
 		 621 aa  149  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.99 
 
 		 999 aa  149  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  34.09 
 
 		 606 aa  148  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  32.18 
 
 		 596 aa  148  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  32.59 
 
 		 607 aa  148  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2980  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.8 
 
 		 602 aa  147  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  35.89 
 
 		 598 aa  147  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3070  ABC transporter related  37.22 
 
 		 604 aa  147  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.195979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  32.18 
 
 		 596 aa  147  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  34.26 
 
 		 631 aa  147  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  33.59 
 
 		 592 aa  148  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  31.01 
 
 		 608 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.53 
 
 		 1115 aa  147  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  34.05 
 
 		 592 aa  147  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0822  ABC transporter related  35.36 
 
 		 640 aa  147  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0882213  hitchhiker  0.0000266707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  34.73 
 
 		 606 aa  146  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  35.97 
 
 		 611 aa  147  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  32.96 
 
 		 624 aa  146  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  34.05 
 
 		 727 aa  146  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>