More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54822 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  39.09 
 
 		 1535 aa  1024    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  39.37 
 
 		 1549 aa  1035    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  42.57 
 
 		 1640 aa  1228    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  100 
 
 		 1549 aa  3170    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  37.92 
 
 		 1587 aa  879    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  43.14 
 
 		 1157 aa  965    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  33.44 
 
 		 1168 aa  644    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  32.36 
 
 		 1256 aa  665    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  42.64 
 
 		 1573 aa  1172    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  32.27 
 
 		 1667 aa  628  1e-178  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  31.24 
 
 		 1636 aa  625  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  32.59 
 
 		 1135 aa  616  9.999999999999999e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  31.68 
 
 		 1317 aa  606  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  31.36 
 
 		 1396 aa  602  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  30.8 
 
 		 1458 aa  574  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  30.91 
 
 		 1367 aa  573  1e-161  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  29.89 
 
 		 1423 aa  560  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.26 
 
 		 1669 aa  558  1e-157  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  32.45 
 
 		 1381 aa  546  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.84 
 
 		 1705 aa  528  1e-148  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  35.68 
 
 		 1513 aa  519  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.78 
 
 		 1659 aa  516  1e-144  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  30.15 
 
 		 1514 aa  510  1e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  30.54 
 
 		 1611 aa  512  1e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  27.63 
 
 		 1507 aa  505  1e-141  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  30.13 
 
 		 1248 aa  506  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  29.16 
 
 		 1351 aa  460  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  28.7 
 
 		 1127 aa  462  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  28.15 
 
 		 1463 aa  444  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.58 
 
 		 1456 aa  439  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  27.25 
 
 		 1557 aa  426  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  28.9 
 
 		 1607 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.63 
 
 		 1115 aa  400  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  33 
 
 		 1623 aa  320  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  36.19 
 
 		 1416 aa  302  4e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  27.8 
 
 		 1511 aa  233  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  31.78 
 
 		 1562 aa  225  4e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.6 
 
 		 1773 aa  214  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  29.36 
 
 		 980 aa  191  8e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  28.57 
 
 		 930 aa  189  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.16 
 
 		 589 aa  187  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  27.99 
 
 		 622 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  27.72 
 
 		 592 aa  187  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  27.89 
 
 		 598 aa  186  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.25 
 
 		 603 aa  185  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  27.88 
 
 		 582 aa  184  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.35 
 
 		 583 aa  183  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  29.1 
 
 		 577 aa  183  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.71 
 
 		 971 aa  181  8e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.85 
 
 		 579 aa  181  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.9 
 
 		 589 aa  179  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  27.71 
 
 		 610 aa  179  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  27.52 
 
 		 640 aa  179  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  27.68 
 
 		 739 aa  178  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  26.85 
 
 		 578 aa  178  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.98 
 
 		 1008 aa  178  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.98 
 
 		 1008 aa  178  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  27.45 
 
 		 892 aa  178  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  26.96 
 
 		 610 aa  177  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  27.02 
 
 		 602 aa  177  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  27.06 
 
 		 597 aa  177  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  26.9 
 
 		 741 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  27.71 
 
 		 865 aa  176  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  26.04 
 
 		 578 aa  175  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  28.51 
 
 		 712 aa  175  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  26.98 
 
 		 640 aa  175  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.76 
 
 		 597 aa  174  9e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  27.76 
 
 		 619 aa  174  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  29.45 
 
 		 724 aa  174  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  29.45 
 
 		 724 aa  174  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.49 
 
 		 571 aa  174  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  27.93 
 
 		 731 aa  174  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  25.91 
 
 		 588 aa  173  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  28.12 
 
 		 622 aa  173  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  28.89 
 
 		 613 aa  174  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  25.93 
 
 		 588 aa  173  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  28.95 
 
 		 621 aa  173  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.68 
 
 		 976 aa  173  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  28.06 
 
 		 705 aa  172  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  26.2 
 
 		 597 aa  173  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  27.42 
 
 		 606 aa  173  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3070  ABC transporter related  29.18 
 
 		 604 aa  172  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.195979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  28.28 
 
 		 592 aa  173  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.32 
 
 		 571 aa  172  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  27.55 
 
 		 663 aa  172  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  25.34 
 
 		 602 aa  172  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.06 
 
 		 1019 aa  172  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  29.55 
 
 		 741 aa  172  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  27.03 
 
 		 590 aa  172  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  26.47 
 
 		 618 aa  171  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  28.05 
 
 		 598 aa  171  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  26.42 
 
 		 571 aa  171  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.32 
 
 		 571 aa  171  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.32 
 
 		 571 aa  171  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.32 
 
 		 571 aa  171  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.32 
 
 		 571 aa  171  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  24.55 
 
 		 1284 aa  171  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  27.81 
 
 		 617 aa  171  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  28.23 
 
 		 575 aa  171  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.63 
 
 		 590 aa  171  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>