More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40574 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.74 
 
 		 1396 aa  872    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  45.17 
 
 		 1367 aa  1218    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  52.3 
 
 		 1423 aa  1441    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  49.1 
 
 		 1458 aa  1392    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  35.06 
 
 		 1513 aa  772    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  100 
 
 		 1381 aa  2832    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  29.79 
 
 		 1317 aa  627  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  31.4 
 
 		 1549 aa  623  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  30.77 
 
 		 1587 aa  616  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  33.42 
 
 		 1135 aa  610  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  29.89 
 
 		 1535 aa  600  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  32.22 
 
 		 1507 aa  597  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  30.73 
 
 		 1256 aa  595  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  32.5 
 
 		 1157 aa  587  1e-166  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  32.61 
 
 		 1549 aa  578  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  28.26 
 
 		 1667 aa  564  1.0000000000000001e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  30.34 
 
 		 1640 aa  565  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  30.31 
 
 		 1168 aa  560  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  30.91 
 
 		 1573 aa  557  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  29.95 
 
 		 1636 aa  555  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  28.16 
 
 		 1416 aa  516  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  28.68 
 
 		 1248 aa  515  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  30.78 
 
 		 1127 aa  491  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  29.46 
 
 		 1611 aa  487  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.42 
 
 		 1705 aa  485  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.53 
 
 		 1623 aa  476  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  29.2 
 
 		 1514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.12 
 
 		 1659 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  26.3 
 
 		 1557 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  27.94 
 
 		 1607 aa  429  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  25.98 
 
 		 1456 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  26.42 
 
 		 1463 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.77 
 
 		 1115 aa  337  1e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  24.11 
 
 		 1511 aa  320  7.999999999999999e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  33.82 
 
 		 1669 aa  319  2e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  25.68 
 
 		 1562 aa  319  2e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  32.21 
 
 		 1351 aa  285  3.0000000000000004e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  25.75 
 
 		 1218 aa  231  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  30.05 
 
 		 594 aa  221  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  30.4 
 
 		 587 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  30.4 
 
 		 587 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  32.21 
 
 		 592 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.4 
 
 		 587 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.4 
 
 		 587 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  30.51 
 
 		 587 aa  216  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 		 587 aa  214  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.05 
 
 		 587 aa  213  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  31.42 
 
 		 592 aa  213  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.14 
 
 		 587 aa  212  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  30.34 
 
 		 587 aa  211  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  30.85 
 
 		 587 aa  211  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  29.83 
 
 		 594 aa  210  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  30.87 
 
 		 597 aa  209  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  30.87 
 
 		 597 aa  209  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.24 
 
 		 597 aa  209  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.85 
 
 		 589 aa  208  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  30.11 
 
 		 588 aa  207  9e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  32.6 
 
 		 663 aa  207  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  31 
 
 		 733 aa  206  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  30.61 
 
 		 635 aa  206  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  30.35 
 
 		 592 aa  205  5e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  30.3 
 
 		 607 aa  205  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  31.42 
 
 		 610 aa  204  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  30.41 
 
 		 642 aa  204  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.99 
 
 		 581 aa  203  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  30.31 
 
 		 589 aa  203  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03608  ABC transporter protein AtrC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y748]  24.08 
 
 		 1266 aa  201  7e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  31.58 
 
 		 592 aa  201  7e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  29.46 
 
 		 617 aa  201  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.52 
 
 		 1773 aa  200  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.53 
 
 		 604 aa  199  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  29.03 
 
 		 622 aa  198  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  30.04 
 
 		 586 aa  198  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  29.54 
 
 		 587 aa  198  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  29.1 
 
 		 666 aa  197  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.35 
 
 		 677 aa  196  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  31.18 
 
 		 611 aa  196  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  30.19 
 
 		 600 aa  196  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.55 
 
 		 597 aa  196  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  24.41 
 
 		 1228 aa  195  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  29.09 
 
 		 590 aa  196  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.52 
 
 		 599 aa  195  4e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  30.65 
 
 		 598 aa  194  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  29.04 
 
 		 594 aa  194  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  31.31 
 
 		 610 aa  194  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  31.31 
 
 		 610 aa  194  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  31.62 
 
 		 600 aa  194  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  24.64 
 
 		 1231 aa  193  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  30.26 
 
 		 598 aa  193  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.24 
 
 		 579 aa  192  4e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  28.84 
 
 		 623 aa  192  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.11 
 
 		 583 aa  191  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  31.43 
 
 		 607 aa  191  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  29.47 
 
 		 665 aa  190  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  23.05 
 
 		 1284 aa  190  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  31.29 
 
 		 619 aa  190  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  29.09 
 
 		 600 aa  189  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  30.77 
 
 		 598 aa  189  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  30.66 
 
 		 765 aa  189  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  29.51 
 
 		 591 aa  189  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>