More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE02840 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  100 
 
 		 1659 aa  3410    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  31.27 
 
 		 1607 aa  641    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  31.8 
 
 		 1611 aa  608  9.999999999999999e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  30.13 
 
 		 1562 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  29.97 
 
 		 1549 aa  558  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  31.87 
 
 		 1535 aa  550  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  31.68 
 
 		 1157 aa  523  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  31.94 
 
 		 1549 aa  511  1e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  30.72 
 
 		 1640 aa  505  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  31.8 
 
 		 1507 aa  497  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  30.69 
 
 		 1317 aa  495  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  31.18 
 
 		 1573 aa  494  9.999999999999999e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  28.91 
 
 		 1168 aa  493  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  31.22 
 
 		 1587 aa  486  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  27.63 
 
 		 1256 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  29.6 
 
 		 1367 aa  474  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  29.83 
 
 		 1423 aa  455  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  28.98 
 
 		 1458 aa  424  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  29.38 
 
 		 1381 aa  426  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  42.56 
 
 		 1636 aa  423  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  42.67 
 
 		 1667 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  27.42 
 
 		 1248 aa  398  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.29 
 
 		 1669 aa  376  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.13 
 
 		 1396 aa  348  6e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  36.13 
 
 		 1513 aa  318  7e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  34.82 
 
 		 1514 aa  312  2.9999999999999997e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  34.1 
 
 		 1705 aa  303  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  35.18 
 
 		 1623 aa  294  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  33.71 
 
 		 1416 aa  278  4e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  33.46 
 
 		 1135 aa  276  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  34.07 
 
 		 1127 aa  265  6e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  33.02 
 
 		 1351 aa  261  6e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  33.53 
 
 		 1463 aa  234  7.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  32.28 
 
 		 1456 aa  225  4.9999999999999996e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  31.96 
 
 		 1557 aa  223  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.21 
 
 		 1773 aa  192  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.87117 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  31.21 
 
 		 1115 aa  186  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.27 
 
 		 971 aa  155  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  28.43 
 
 		 592 aa  155  5e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  28.17 
 
 		 634 aa  155  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  25.66 
 
 		 1511 aa  153  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  26.02 
 
 		 742 aa  152  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.99 
 
 		 1179 aa  151  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  26.32 
 
 		 592 aa  149  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  27 
 
 		 680 aa  149  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  25.29 
 
 		 968 aa  147  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.76 
 
 		 581 aa  147  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56634  mitochondrial ABC transporter  33.33 
 
 		 622 aa  146  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.718195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  26.46 
 
 		 622 aa  146  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  36.65 
 
 		 665 aa  145  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.37 
 
 		 604 aa  145  7e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  31.88 
 
 		 930 aa  144  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  35.29 
 
 		 606 aa  144  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  25.68 
 
 		 741 aa  144  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  33.33 
 
 		 597 aa  143  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  26.2 
 
 		 1003 aa  143  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  26.89 
 
 		 598 aa  143  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  34.31 
 
 		 655 aa  143  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  33.53 
 
 		 662 aa  143  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  27.18 
 
 		 598 aa  142  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  33.53 
 
 		 663 aa  143  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  27.13 
 
 		 755 aa  142  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.05 
 
 		 741 aa  142  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  27.18 
 
 		 598 aa  142  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  33.24 
 
 		 640 aa  141  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  25.59 
 
 		 596 aa  140  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  27.98 
 
 		 741 aa  140  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  29.78 
 
 		 980 aa  140  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  24.22 
 
 		 610 aa  140  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  30.91 
 
 		 607 aa  140  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  26.47 
 
 		 593 aa  140  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  32.23 
 
 		 577 aa  140  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  26.13 
 
 		 672 aa  139  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  31.85 
 
 		 595 aa  139  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  28.92 
 
 		 593 aa  139  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.94 
 
 		 976 aa  139  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  26.32 
 
 		 622 aa  139  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.79 
 
 		 579 aa  138  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08241  putative multidrug efflux ABC transporter  26.79 
 
 		 598 aa  138  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  29.29 
 
 		 753 aa  138  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  26.31 
 
 		 602 aa  138  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05528  ABC transporter (Eurofung)  31.76 
 
 		 721 aa  138  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649835  normal  0.920621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  27.24 
 
 		 608 aa  138  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  27.45 
 
 		 663 aa  137  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  27.1 
 
 		 592 aa  138  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.6 
 
 		 586 aa  138  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  26.43 
 
 		 620 aa  137  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  30.81 
 
 		 652 aa  137  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  26.92 
 
 		 585 aa  137  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  32.85 
 
 		 672 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  25.17 
 
 		 581 aa  137  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  25.86 
 
 		 626 aa  136  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  31.27 
 
 		 606 aa  136  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1108  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.72 
 
 		 592 aa  136  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.689619  hitchhiker  0.00000403597 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  25.37 
 
 		 671 aa  136  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  31.33 
 
 		 606 aa  136  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  26.68 
 
 		 580 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  33 
 
 		 642 aa  136  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.25 
 
 		 589 aa  135  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  31.49 
 
 		 596 aa  135  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>