More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_18826 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.32 
 
 
1396 aa  714    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  35.32 
 
 
1535 aa  700    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  33.82 
 
 
1667 aa  642    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  35.34 
 
 
1157 aa  640    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  35.74 
 
 
1549 aa  704    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  100 
 
 
1135 aa  2331    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  36.09 
 
 
1168 aa  686    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  36.26 
 
 
1256 aa  707    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  32.78 
 
 
1669 aa  642    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  36.46 
 
 
1636 aa  707    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  37.88 
 
 
1317 aa  740    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  32.59 
 
 
1549 aa  604  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  33.86 
 
 
1623 aa  589  1e-166  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  31.68 
 
 
1640 aa  585  1.0000000000000001e-165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.83 
 
 
1705 aa  581  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  31.7 
 
 
1573 aa  577  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  31.58 
 
 
1367 aa  574  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  33.45 
 
 
1381 aa  575  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  38.6 
 
 
1513 aa  568  1e-160  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  33.45 
 
 
1127 aa  564  1.0000000000000001e-159  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  32.35 
 
 
1507 aa  560  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  33.14 
 
 
1416 aa  557  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  35.95 
 
 
1458 aa  546  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  32.38 
 
 
1248 aa  546  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  36.05 
 
 
1423 aa  540  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  31.21 
 
 
1514 aa  524  1e-147  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866258 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  30.63 
 
 
1456 aa  478  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  30.63 
 
 
1607 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  40.87 
 
 
1587 aa  452  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  30.68 
 
 
1611 aa  448  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.576912 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  29.93 
 
 
1463 aa  444  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  30.17 
 
 
1557 aa  439  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.4 
 
 
1115 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  26.51 
 
 
1511 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  28.51 
 
 
1562 aa  354  5e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  35.94 
 
 
1351 aa  320  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  33.46 
 
 
1659 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.27 
 
 
597 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.07 
 
 
597 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  30.33 
 
 
1773 aa  222  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  30.24 
 
 
663 aa  219  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  30.52 
 
 
617 aa  216  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  30.83 
 
 
620 aa  212  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  30.43 
 
 
620 aa  211  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  29.53 
 
 
615 aa  210  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  28.8 
 
 
582 aa  209  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  30.8 
 
 
609 aa  209  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  29.94 
 
 
765 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  30.58 
 
 
630 aa  206  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  28.74 
 
 
634 aa  206  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  29.64 
 
 
640 aa  205  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.53 
 
 
581 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  28.71 
 
 
587 aa  203  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  28.71 
 
 
587 aa  203  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  28.52 
 
 
587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.71 
 
 
587 aa  203  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  30.48 
 
 
625 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.71 
 
 
587 aa  203  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.94 
 
 
618 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.09 
 
 
579 aa  202  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  31.45 
 
 
677 aa  202  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  28.76 
 
 
618 aa  202  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.52 
 
 
587 aa  201  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  29.29 
 
 
600 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.52 
 
 
587 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  30.6 
 
 
594 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  26.54 
 
 
587 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.15 
 
 
598 aa  199  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.85 
 
 
598 aa  199  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  28.54 
 
 
625 aa  198  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  30.11 
 
 
607 aa  198  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  29.03 
 
 
605 aa  198  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.26 
 
 
595 aa  197  7e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  30.68 
 
 
592 aa  197  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  26.7 
 
 
587 aa  197  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  28.15 
 
 
631 aa  197  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  28.94 
 
 
669 aa  197  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  29.58 
 
 
594 aa  197  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  30.38 
 
 
598 aa  196  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  29.46 
 
 
592 aa  196  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.8 
 
 
598 aa  196  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.79 
 
 
641 aa  196  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  27.78 
 
 
661 aa  195  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.17 
 
 
597 aa  196  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  26.99 
 
 
609 aa  195  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  26.58 
 
 
613 aa  195  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  28.65 
 
 
628 aa  195  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  26.69 
 
 
631 aa  195  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.6 
 
 
598 aa  195  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  27.63 
 
 
672 aa  195  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  29.9 
 
 
592 aa  195  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  28.46 
 
 
631 aa  194  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  28.46 
 
 
631 aa  194  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  28.93 
 
 
631 aa  194  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  24.54 
 
 
1218 aa  194  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00401  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  30 
 
 
593 aa  194  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0485  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30 
 
 
593 aa  194  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00405  hypothetical protein  30 
 
 
593 aa  194  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3160  ABC transporter related protein  30 
 
 
593 aa  194  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0537  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30 
 
 
593 aa  194  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>