More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_36940 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.62 
 
 		 1396 aa  679    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  45.59 
 
 		 1535 aa  1011    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  33.92 
 
 		 1667 aa  659    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  35.01 
 
 		 1168 aa  676    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  100 
 
 		 1157 aa  2367    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  43.03 
 
 		 1573 aa  908    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  43.14 
 
 		 1549 aa  973    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  40.11 
 
 		 1587 aa  883    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  33.25 
 
 		 1256 aa  654    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  48.37 
 
 		 1549 aa  1095    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  35.34 
 
 		 1135 aa  654    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  42.59 
 
 		 1640 aa  934    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  33.89 
 
 		 1317 aa  666    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  34.11 
 
 		 1636 aa  640    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  31.85 
 
 		 1367 aa  592  1e-167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  31.09 
 
 		 1458 aa  575  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  32.72 
 
 		 1507 aa  559  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  32.5 
 
 		 1381 aa  561  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  33.14 
 
 		 1611 aa  556  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  33.24 
 
 		 1623 aa  549  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  36.61 
 
 		 1513 aa  530  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  31.64 
 
 		 1514 aa  524  1e-147  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.77 
 
 		 1705 aa  525  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.76 
 
 		 1659 aa  519  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  31.28 
 
 		 1127 aa  507  9.999999999999999e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  31.47 
 
 		 1416 aa  508  9.999999999999999e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  32.14 
 
 		 1248 aa  493  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  31.59 
 
 		 1351 aa  491  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  29.93 
 
 		 1607 aa  477  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  29.55 
 
 		 1463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  29.13 
 
 		 1557 aa  437  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.83 
 
 		 1456 aa  424  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.83 
 
 		 1115 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  36.86 
 
 		 1423 aa  388  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  26.27 
 
 		 1511 aa  379  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  27.54 
 
 		 1562 aa  378  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  33.78 
 
 		 1669 aa  328  3e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  23.15 
 
 		 1264 aa  204  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.81 
 
 		 1773 aa  204  9e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.94 
 
 		 738 aa  194  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.06 
 
 		 597 aa  192  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  27.41 
 
 		 587 aa  189  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  27.24 
 
 		 587 aa  188  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  27.7 
 
 		 587 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  27.7 
 
 		 587 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.7 
 
 		 587 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.7 
 
 		 587 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  27.53 
 
 		 587 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.35 
 
 		 587 aa  184  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.35 
 
 		 587 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  27.41 
 
 		 593 aa  182  2.9999999999999997e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  27.73 
 
 		 640 aa  181  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  29 
 
 		 622 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.5 
 
 		 971 aa  179  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  28.12 
 
 		 587 aa  179  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  27.42 
 
 		 587 aa  178  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  27.43 
 
 		 622 aa  177  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.71 
 
 		 586 aa  177  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.43 
 
 		 578 aa  177  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.63 
 
 		 579 aa  177  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.76 
 
 		 586 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  27.31 
 
 		 556 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.35 
 
 		 586 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  29.1 
 
 		 594 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  29.62 
 
 		 600 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  28.37 
 
 		 611 aa  175  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  27 
 
 		 619 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.53 
 
 		 581 aa  174  5.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  30.14 
 
 		 586 aa  173  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  26.92 
 
 		 594 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  28.52 
 
 		 577 aa  174  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.78 
 
 		 589 aa  173  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.35 
 
 		 586 aa  173  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  28.98 
 
 		 597 aa  172  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10431  ABC transporter  28.17 
 
 		 548 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  29.94 
 
 		 592 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  27.89 
 
 		 594 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.35 
 
 		 586 aa  173  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.35 
 
 		 586 aa  172  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  29.35 
 
 		 586 aa  172  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.37 
 
 		 597 aa  172  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.51 
 
 		 976 aa  172  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.35 
 
 		 586 aa  172  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.83 
 
 		 1000 aa  172  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  28.34 
 
 		 586 aa  172  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  28.4 
 
 		 650 aa  171  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.15 
 
 		 586 aa  171  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  30.18 
 
 		 620 aa  171  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  27.1 
 
 		 669 aa  171  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  32.5 
 
 		 455 aa  171  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  27.36 
 
 		 672 aa  169  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  28.77 
 
 		 727 aa  169  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.29 
 
 		 1013 aa  169  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  26.73 
 
 		 742 aa  169  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  27.36 
 
 		 626 aa  169  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  27.39 
 
 		 588 aa  168  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  25.92 
 
 		 588 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  28.51 
 
 		 619 aa  167  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  27.83 
 
 		 600 aa  167  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  30.49 
 
 		 677 aa  167  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>