More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30251 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  39.54 
 
 		 1535 aa  1008    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  41.24 
 
 		 1549 aa  1037    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  38.18 
 
 		 1587 aa  867    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  43.23 
 
 		 1549 aa  1239    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  42.18 
 
 		 1157 aa  919    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  82.39 
 
 		 1573 aa  2593    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  100 
 
 		 1640 aa  3369    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  32.24 
 
 		 1168 aa  616  9.999999999999999e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  29.58 
 
 		 1256 aa  614  9.999999999999999e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  31 
 
 		 1317 aa  605  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  30.01 
 
 		 1636 aa  604  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  32.2 
 
 		 1135 aa  596  1e-168  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  29.71 
 
 		 1367 aa  565  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  32.13 
 
 		 1513 aa  563  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  30.34 
 
 		 1381 aa  548  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  28.87 
 
 		 1423 aa  544  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  30.36 
 
 		 1458 aa  535  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  30.36 
 
 		 1507 aa  527  1e-148  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.7 
 
 		 1659 aa  511  1e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  31.31 
 
 		 1248 aa  511  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  28.81 
 
 		 1669 aa  499  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  27.4 
 
 		 1611 aa  496  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  29.9 
 
 		 1351 aa  483  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  28.4 
 
 		 1514 aa  439  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  27.53 
 
 		 1463 aa  437  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.28 
 
 		 1456 aa  436  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  27.77 
 
 		 1607 aa  402  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  37.5 
 
 		 1396 aa  387  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  37.37 
 
 		 1667 aa  386  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  35.26 
 
 		 1623 aa  336  2e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  37.92 
 
 		 1127 aa  327  9e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  36.69 
 
 		 1416 aa  321  7e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  35.48 
 
 		 1705 aa  310  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  30.77 
 
 		 1557 aa  283  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  30.48 
 
 		 1562 aa  207  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  26.03 
 
 		 1511 aa  192  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.14 
 
 		 1115 aa  188  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.49 
 
 		 583 aa  187  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  29.3 
 
 		 622 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  28.33 
 
 		 610 aa  182  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  26.49 
 
 		 622 aa  181  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  25.75 
 
 		 621 aa  180  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  29.11 
 
 		 706 aa  180  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  29.39 
 
 		 590 aa  180  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  29.27 
 
 		 590 aa  179  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  27.83 
 
 		 616 aa  179  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  29.01 
 
 		 607 aa  178  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  28.24 
 
 		 592 aa  178  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.46 
 
 		 738 aa  176  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  26.48 
 
 		 601 aa  176  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.52 
 
 		 597 aa  176  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  26.07 
 
 		 609 aa  175  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  27.56 
 
 		 626 aa  174  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  27.55 
 
 		 609 aa  174  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2206  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.24 
 
 		 612 aa  174  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  26.93 
 
 		 634 aa  174  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  27.55 
 
 		 592 aa  174  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  28.15 
 
 		 619 aa  174  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.98 
 
 		 603 aa  174  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  28.86 
 
 		 714 aa  174  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  25.93 
 
 		 571 aa  173  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  27.09 
 
 		 725 aa  172  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.43 
 
 		 1024 aa  172  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  27.31 
 
 		 611 aa  172  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  29.98 
 
 		 612 aa  172  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  26.76 
 
 		 980 aa  171  8e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  26.79 
 
 		 640 aa  171  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  38.95 
 
 		 609 aa  171  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  28.35 
 
 		 594 aa  171  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  28.22 
 
 		 590 aa  171  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  29.9 
 
 		 716 aa  171  9e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  29.08 
 
 		 596 aa  171  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.27 
 
 		 589 aa  171  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  28.54 
 
 		 596 aa  170  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  28.27 
 
 		 728 aa  171  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  26.84 
 
 		 699 aa  169  2.9999999999999998e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  29.63 
 
 		 727 aa  170  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  26.67 
 
 		 609 aa  169  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.54 
 
 		 1008 aa  168  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  28.88 
 
 		 612 aa  168  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.54 
 
 		 1008 aa  168  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.88 
 
 		 641 aa  168  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  24.76 
 
 		 590 aa  168  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  26.97 
 
 		 611 aa  168  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 608 aa  168  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  28.48 
 
 		 590 aa  168  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  30.19 
 
 		 739 aa  168  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.98 
 
 		 597 aa  168  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  27.17 
 
 		 592 aa  167  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.27 
 
 		 582 aa  167  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  26.76 
 
 		 571 aa  167  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.76 
 
 		 571 aa  167  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.76 
 
 		 571 aa  167  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  26.18 
 
 		 610 aa  167  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.76 
 
 		 571 aa  167  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.76 
 
 		 571 aa  167  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  28.25 
 
 		 590 aa  166  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  25.17 
 
 		 614 aa  167  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.76 
 
 		 571 aa  167  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1348  ABC transporter related  26.3 
 
 		 610 aa  167  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416951  normal  0.150129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>