More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0199 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0199  TatD family protein  100 
 
 		 237 aa  491  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4182  TatD-related deoxyribonuclease  37.38 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2775  TatD-related deoxyribonuclease  38.73 
 
 		 217 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.115989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0828  TatD-related deoxyribonuclease  34 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.137921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  37.82 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  34.33 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  33.58 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  32.8 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  29.57 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  30.77 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  34.96 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  32.89 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  35.44 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  36.09 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  36.24 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0194  hydrolase, TatD family protein  28.85 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0500604  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  31.79 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  32.47 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  36.81 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  31.48 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  35.43 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  29.25 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  34.18 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  33.59 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  31.82 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  31.82 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  35.1 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  31.06 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  29.6 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  35.77 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  32.26 
 
 		 258 aa  72  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  32.77 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  31.85 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  35.2 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  27.66 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  35.71 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  31.75 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  29.27 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0124  TatD family hydrolase  30.66 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  31.34 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  31.82 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  33.12 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  32.59 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  36.97 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  33.09 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  36.21 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  32.92 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  31.33 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  33.06 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  29.51 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  31.82 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  30.3 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1824  TatD-related deoxyribonuclease  30.77 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  28.93 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.2 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  31.58 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  32.62 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  33.09 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  29.53 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  34.04 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  31.71 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0891  Sec-independent protein translocase TatD  32.5 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0017  deoxyribonuclease, TatD family  31.61 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  26.38 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  30.58 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  32.2 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  29.53 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  28 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  27.27 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  32.5 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  31.62 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  35.2 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  34.46 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  28.8 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1991  TatD-related deoxyribonuclease  31.06 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.126048  decreased coverage  0.0000779322 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  28.8 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  28.8 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  31.62 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  35 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0999  TatD-related deoxyribonuclease  32.84 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000160958  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  34.06 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1195  hydrolase, TatD family  33.59 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  30.5 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  30.46 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  29.38 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  34.45 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  30.83 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  29.17 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  35 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  33.9 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  33.9 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  32.52 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  30.89 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  31.03 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>