More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2775 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2775  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
217 aa  437  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.115989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4182  TatD-related deoxyribonuclease  36.92 
 
 
218 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_002950  PG0199  TatD family protein  38.73 
 
 
237 aa  131  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0828  TatD-related deoxyribonuclease  36.92 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.137921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  29.95 
 
 
263 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 
254 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  37.75 
 
 
255 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 
254 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 
254 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  35.81 
 
 
276 aa  99.4  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  37.09 
 
 
255 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  37.09 
 
 
256 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  36.25 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  35.53 
 
 
254 aa  95.5  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  36.84 
 
 
254 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  32.35 
 
 
278 aa  93.2  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1277  TatD-related deoxyribonuclease  28.38 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0999  TatD-related deoxyribonuclease  39.47 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000160958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  34.48 
 
 
263 aa  89  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  35.29 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  32.68 
 
 
257 aa  85.5  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  31.61 
 
 
258 aa  85.1  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1824  TatD-related deoxyribonuclease  24.5 
 
 
258 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  33.54 
 
 
253 aa  84.7  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  30.36 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  29.86 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0250  TatD-related deoxyribonuclease  24 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.81 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  27.06 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  30.92 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3175  TatD-related deoxyribonuclease  29.93 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2106  TatD-related deoxyribonuclease  28.39 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  27.19 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2036  TatD-related deoxyribonuclease  28.39 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  26.17 
 
 
283 aa  79  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  34 
 
 
464 aa  78.2  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  31.94 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  29.02 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  30.87 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  30.11 
 
 
268 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  33.99 
 
 
273 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  31.87 
 
 
267 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  33.11 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  33.56 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  30.72 
 
 
264 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0194  hydrolase, TatD family protein  32.74 
 
 
269 aa  75.1  0.0000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0500604  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  35.48 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  32.68 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  31.98 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  27.52 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  27.67 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  28.67 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0660  hydrolase, TatD family  30.29 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  32.2 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  32.93 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  28.57 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  33.55 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  34.44 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  34.21 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  27.5 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  35.33 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  29.9 
 
 
255 aa  72  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  30.89 
 
 
254 aa  72  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  35.33 
 
 
283 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  31.21 
 
 
260 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  35.33 
 
 
283 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  35.33 
 
 
283 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  34.23 
 
 
255 aa  71.6  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1996  TatD-related deoxyribonuclease  25 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0653  TatD-related deoxyribonuclease  35.26 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0953194  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  23.74 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  27.33 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  32.47 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  29.33 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  35.1 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  30.23 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  30.2 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  33.77 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  34.62 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  29.27 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  29.31 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  30.2 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0966  TatD family hydrolase  30 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.732355  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0017  deoxyribonuclease, TatD family  34.84 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  26.49 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  27.65 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  31.71 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  29.38 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  25.12 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  30.1 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  33.77 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  27.69 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  27.5 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  36.73 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  24.75 
 
 
459 aa  70.1  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  30.1 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  33.14 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  25.12 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  28 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.896623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>