238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1277 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1277  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2775  TatD-related deoxyribonuclease  28.38 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.115989  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0250  TatD-related deoxyribonuclease  28.42 
 
 
296 aa  85.5  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  25.56 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  31.67 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  29.36 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  30.53 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0199  TatD-related deoxyribonuclease  30.49 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47161  predicted protein  27.98 
 
 
379 aa  72  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0374083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  29.06 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0828  TatD-related deoxyribonuclease  31.22 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.137921  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1308  TatD-related deoxyribonuclease  27.84 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.700571  normal  0.456144 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf006  TatD-related DNase  31.79 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  27.07 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  28.42 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11690  predicted protein  26.05 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  25.11 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4182  TatD-related deoxyribonuclease  26.32 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  24.51 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  28.5 
 
 
263 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  23.95 
 
 
263 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  25.49 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  26.32 
 
 
255 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  27.32 
 
 
276 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3175  TatD-related deoxyribonuclease  26.58 
 
 
275 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3606  TatD family hydrolase  34.64 
 
 
269 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000130951  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  27.6 
 
 
278 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  25.88 
 
 
255 aa  62.4  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  25.48 
 
 
258 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2900  Mg-dependent DNase TatD  29.94 
 
 
255 aa  62  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000278617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1227  hydrolase, TatD family  23.87 
 
 
253 aa  61.6  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  25.48 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  29.57 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3015  TatD family deoxyribonuclease  33.33 
 
 
262 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.91144e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  26.73 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  27.41 
 
 
257 aa  59.3  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl048  Mg2+ dependent DNAse  27.22 
 
 
263 aa  58.5  0.00000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2208  TatD-related deoxyribonuclease  25.74 
 
 
267 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  30.22 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  26.96 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  28.26 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  28.26 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1998  TatD-related deoxyribonuclease  23.11 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  27.49 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  27.87 
 
 
260 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  24.66 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  26.29 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  29.67 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  28.26 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  26.51 
 
 
253 aa  56.6  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  35.86 
 
 
267 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  32.22 
 
 
257 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  29.67 
 
 
290 aa  55.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  27.32 
 
 
260 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  29.13 
 
 
267 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  27.32 
 
 
260 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  35.86 
 
 
267 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  34.07 
 
 
255 aa  55.5  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  26.79 
 
 
255 aa  55.1  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  27.32 
 
 
260 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  28.4 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  26.7 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  25.65 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  29.89 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  27.32 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0939  TatD-related deoxyribonuclease  24.68 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  24.43 
 
 
259 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1469  TatD-related deoxyribonuclease  26.17 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170381  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  23.67 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  27.87 
 
 
251 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_50114  predicted protein  23.95 
 
 
338 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.975027  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  28.65 
 
 
254 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0966  TatD family hydrolase  28.24 
 
 
273 aa  53.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.732355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  26.78 
 
 
260 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  25 
 
 
255 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2173  Sec-independent protein translocase TatD  27.38 
 
 
261 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.69531 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  23.08 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  30.52 
 
 
265 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  26.98 
 
 
265 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  29.89 
 
 
254 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2067  TatD-related deoxyribonuclease  27.03 
 
 
252 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  28.49 
 
 
257 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1431  TatD-related deoxyribonuclease  22.86 
 
 
272 aa  52.8  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  28.49 
 
 
257 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  28.49 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  29.89 
 
 
254 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  28.49 
 
 
257 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  32.58 
 
 
265 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  26.48 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  28.49 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  28.79 
 
 
267 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  29.73 
 
 
266 aa  52.4  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  32.93 
 
 
266 aa  52  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1824  TatD-related deoxyribonuclease  29.13 
 
 
258 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2071  TatD-related deoxyribonuclease  26.67 
 
 
234 aa  52  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.270704  normal  0.0636834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  26.34 
 
 
232 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  28.23 
 
 
267 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  28 
 
 
265 aa  51.6  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0883  mttC protein, putative  26.7 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.162924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  33.33 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>