More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2067 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2067  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 252 aa  505  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0256  putative deoxyribonuclease, TatD family  32.41 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  32.02 
 
 		 265 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0198  TatD-related deoxyribonuclease  31.62 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.865826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0212  TatD family deoxyribonuclease  31.23 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0222  TatD family deoxyribonuclease  31.23 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5088  putative deoxyribonuclease, TatD family  32.41 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.279248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0231  putative deoxyribonuclease, TatD family  30.83 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0199  TatD-related deoxyribonuclease  31.91 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0238  putative deoxyribonuclease, TatD family  31.62 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0202  TatD-related deoxyribonuclease  30.43 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1025  TatD-related deoxyribonuclease  32.39 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609004 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1823  TatD-related deoxyribonuclease  31.17 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00210636  hitchhiker  0.000000000367552 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1295  TatD-related deoxyribonuclease  30.77 
 
 		 234 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2071  TatD-related deoxyribonuclease  32.79 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.270704  normal  0.0636834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1040  TatD-related deoxyribonuclease  27.34 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1855  TatD-related deoxyribonuclease  30.77 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00309398  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1308  TatD-related deoxyribonuclease  28.69 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.700571  normal  0.456144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  27.65 
 
 		 457 aa  99.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1779  TatD-related deoxyribonuclease  28.57 
 
 		 228 aa  95.5  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0199  TatD-related deoxyribonuclease  26.61 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl048  Mg2+ dependent DNAse  25.66 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1998  TatD-related deoxyribonuclease  28.28 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  27.24 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0721  hydrolase, TatD family  26.02 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00103897  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  27.65 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  26.04 
 
 		 260 aa  85.5  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  27.17 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  28.46 
 
 		 278 aa  85.5  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  26.79 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1279  TatD family hydrolase  30.86 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.549557  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  27.86 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  27.38 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  27.38 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  29.5 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  27.82 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  27.38 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  27.14 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  26.89 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  26.04 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  26.79 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1299  TatD family hydrolase  27.31 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  27.27 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  26.79 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  26.97 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  27.94 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  26.05 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  27.07 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  28.21 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  25.1 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  26.64 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  25.67 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  25.67 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  25.67 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  25.67 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  27 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  27.84 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  26.62 
 
 		 462 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0017  deoxyribonuclease, TatD family  28.41 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  27.27 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0883  TatD family hydrolase  33.18 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  25.19 
 
 		 462 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  23.02 
 
 		 461 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1431  TatD-related deoxyribonuclease  27.8 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  27.24 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  23.79 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  26.94 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  27.6 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  25.7 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  28.03 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  27.11 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  26.2 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  25.19 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  26.3 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  27 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  23.89 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  24.44 
 
 		 606 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  25.28 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  27.17 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  25 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  29.05 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  25 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  25.47 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  24.25 
 
 		 270 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  28.24 
 
 		 278 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0124  TatD family hydrolase  24.26 
 
 		 265 aa  72  0.000000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  25.45 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  25.55 
 
 		 262 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  25.55 
 
 		 262 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1030  TatD-related deoxyribonuclease  26.94 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  25.76 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  27.07 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  25.38 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  26.76 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  23.66 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  23.74 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  25.09 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  26.12 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  24.78 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  25.28 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>