More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0943 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  100 
 
 
257 aa  526  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1778  TatD-related deoxyribonuclease  53.63 
 
 
281 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1299  TatD family hydrolase  50 
 
 
251 aa  276  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0883  TatD family hydrolase  41.6 
 
 
253 aa  191  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0817  TatD family hydrolase  41.34 
 
 
251 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.240566  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1100  TatD family hydrolase  40.55 
 
 
251 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0006  TatD family hydrolase  38.98 
 
 
251 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.637647  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  37.07 
 
 
457 aa  168  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  35.77 
 
 
264 aa  164  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  37.31 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  33.98 
 
 
256 aa  159  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1279  TatD family hydrolase  37.31 
 
 
270 aa  159  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.549557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.36 
 
 
257 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  37.55 
 
 
264 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  33.98 
 
 
464 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  35.41 
 
 
256 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  36.68 
 
 
256 aa  155  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  37.07 
 
 
257 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  36.29 
 
 
267 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  35.52 
 
 
256 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  35.52 
 
 
259 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  35.63 
 
 
281 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  34.22 
 
 
263 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  35.52 
 
 
256 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  34.5 
 
 
606 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  33.59 
 
 
258 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  33.72 
 
 
260 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  35.18 
 
 
258 aa  148  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16901  TatD family deoxyribonuclease  35.36 
 
 
264 aa  148  8e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  34.11 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  35.85 
 
 
255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  33.59 
 
 
271 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  36.19 
 
 
268 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  33.2 
 
 
264 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  35.41 
 
 
252 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  35.71 
 
 
257 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  35.71 
 
 
257 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  34.75 
 
 
255 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  35.29 
 
 
261 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  35.85 
 
 
255 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  34.11 
 
 
462 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  35.66 
 
 
462 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.47 
 
 
255 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  35.47 
 
 
255 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  35.47 
 
 
255 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  35.47 
 
 
255 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.47 
 
 
255 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.47 
 
 
255 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  36.12 
 
 
257 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  35.09 
 
 
265 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  36.15 
 
 
255 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  32.81 
 
 
253 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1579  putative deoxyribonuclease, TatD family  34.1 
 
 
264 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  32.45 
 
 
267 aa  142  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.43 
 
 
256 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16771  TatD family deoxyribonuclease  34.1 
 
 
264 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  34.36 
 
 
255 aa  141  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  33.71 
 
 
262 aa  141  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.09 
 
 
255 aa  141  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  33.07 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  33.46 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  35.41 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  33.97 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  35.41 
 
 
253 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  34.47 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  33.59 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  32.05 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  32.95 
 
 
458 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  34.62 
 
 
263 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  34.75 
 
 
263 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  33.46 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  33.21 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  34.4 
 
 
254 aa  139  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  33.85 
 
 
258 aa  138  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  35.43 
 
 
255 aa  138  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  32.43 
 
 
459 aa  139  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  33.84 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.98 
 
 
256 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  33.72 
 
 
258 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  33.98 
 
 
265 aa  137  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  29.8 
 
 
256 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  34.75 
 
 
256 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  35.91 
 
 
264 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  33.08 
 
 
255 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  32.56 
 
 
458 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  32.68 
 
 
255 aa  136  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  32.81 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  35.61 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  35.56 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  31.52 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  33.33 
 
 
263 aa  135  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  34.85 
 
 
258 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  33.2 
 
 
270 aa  135  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  32.43 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  33.98 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  33.46 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  32.56 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  33.2 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  34.38 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>