More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0006 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0006  TatD family hydrolase  100 
 
 		 251 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.637647  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1100  TatD family hydrolase  93.23 
 
 		 251 aa  481  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0817  TatD family hydrolase  92.83 
 
 		 251 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.240566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0883  TatD family hydrolase  72.91 
 
 		 253 aa  390  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1279  TatD family hydrolase  58.37 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.549557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  38.98 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1299  TatD family hydrolase  34.68 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1778  TatD-related deoxyribonuclease  34.78 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  32.55 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  34.21 
 
 		 462 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  33.73 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  32.55 
 
 		 462 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  30.8 
 
 		 606 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  30.2 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  30.43 
 
 		 457 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  32.68 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  30.62 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  32.27 
 
 		 461 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  32.53 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  30.65 
 
 		 458 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  31.25 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  30.98 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  31.37 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  29.84 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  32.81 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  29.89 
 
 		 458 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  32.68 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  30 
 
 		 263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  32.95 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  31.37 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  29.92 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  32.56 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  32.56 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  32.56 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  32.3 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  32.56 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  29.13 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  30.08 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  31.06 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  29.13 
 
 		 258 aa  121  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  35.27 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  29.18 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  29.07 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  24.33 
 
 		 464 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  32.16 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  32 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  32.03 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  30.23 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  29.8 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  30.23 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  30.23 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  30.23 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  28.29 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  26.72 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  30.15 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  30.23 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  30.2 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  29.89 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  29.89 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  30.23 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  29.89 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  31.18 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  28.74 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  29.37 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  30.15 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  30.74 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  29.77 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  29.77 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  29.77 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  29.77 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  27.63 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  30.59 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  32.2 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  30.23 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  28.02 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  30.62 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  31.27 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  31.89 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  29.89 
 
 		 276 aa  115  5e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  30.98 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  27.73 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  29.8 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  29.02 
 
 		 271 aa  115  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  29.57 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  29.64 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  29.92 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  28.08 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  30.83 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  30.98 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  29.5 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2800  putative metallodependent hydrolase  30.23 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.150723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  31.4 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  32.17 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  30.2 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  26.85 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  29.92 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  28.63 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  29.92 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  28.35 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  32.17 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>