More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1778 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1778  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
281 aa  578  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1299  TatD family hydrolase  52.19 
 
 
251 aa  288  6e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  53.63 
 
 
257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  36.78 
 
 
257 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  35.88 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0883  TatD family hydrolase  38.4 
 
 
253 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  34.87 
 
 
457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  37.5 
 
 
271 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  36.47 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  39.53 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  35.77 
 
 
256 aa  161  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  35.47 
 
 
264 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  37.07 
 
 
263 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  36.58 
 
 
256 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  35.16 
 
 
253 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  34.24 
 
 
255 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  38.61 
 
 
256 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  37.21 
 
 
459 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  37.31 
 
 
262 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  37.11 
 
 
268 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  33.98 
 
 
268 aa  158  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  36.96 
 
 
255 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  36.96 
 
 
255 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  36.96 
 
 
255 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  36.96 
 
 
255 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  36.96 
 
 
255 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  36.96 
 
 
255 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  36.96 
 
 
255 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  36.96 
 
 
255 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0817  TatD family hydrolase  35.97 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.240566  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  38.06 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  36.19 
 
 
255 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  32.69 
 
 
464 aa  155  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  36.92 
 
 
263 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1279  TatD family hydrolase  36.92 
 
 
270 aa  154  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.549557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  37.16 
 
 
259 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  36.58 
 
 
255 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  35.16 
 
 
256 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  36.88 
 
 
265 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  36.05 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  34.23 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  34.35 
 
 
264 aa  152  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  36.82 
 
 
263 aa  152  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1100  TatD family hydrolase  35.97 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.162868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  35.69 
 
 
257 aa  151  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0006  TatD family hydrolase  34.78 
 
 
251 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.637647  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  36.68 
 
 
259 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  34.88 
 
 
260 aa  149  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  34.63 
 
 
462 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  34.36 
 
 
260 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  36.43 
 
 
267 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  34.24 
 
 
255 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  34.59 
 
 
273 aa  149  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  33.99 
 
 
257 aa  148  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  34.23 
 
 
255 aa  148  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  34.36 
 
 
256 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  36.72 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  33.98 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16901  TatD family deoxyribonuclease  34.87 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  36.33 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  34.36 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  34.51 
 
 
253 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  36.43 
 
 
255 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  36.05 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  33.73 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  32.32 
 
 
458 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  32.32 
 
 
458 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  36.05 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  32.3 
 
 
606 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  35.14 
 
 
257 aa  145  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  36.88 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  32.57 
 
 
462 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  35.91 
 
 
264 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  32.2 
 
 
263 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  34.88 
 
 
256 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  33.2 
 
 
258 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  31.64 
 
 
256 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  32.69 
 
 
258 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  32.94 
 
 
263 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3651  TatD-related deoxyribonuclease  33.2 
 
 
259 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  31.64 
 
 
256 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  33.46 
 
 
255 aa  143  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  33.2 
 
 
270 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  33.85 
 
 
257 aa  142  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  35.14 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  34.12 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  31.37 
 
 
461 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  31.72 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  33.2 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  33.07 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16771  TatD family deoxyribonuclease  32.57 
 
 
264 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  35.14 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  34.11 
 
 
265 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  33.72 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  31.34 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  30.86 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  35.91 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0543603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>