More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3651 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3651  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 259 aa  520  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1778  TatD-related deoxyribonuclease  33.2 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  35.16 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2029  TatD-related deoxyribonuclease  34.41 
 
 		 253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.755342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  33.99 
 
 		 457 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  32.68 
 
 		 257 aa  131  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  34.35 
 
 		 461 aa  128  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  32.95 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1030  TatD-related deoxyribonuclease  29.8 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  34.57 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  28.4 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  35.69 
 
 		 606 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  34.9 
 
 		 462 aa  125  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0256  putative deoxyribonuclease, TatD family  28.8 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  29.13 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  32.17 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  34.73 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  32.68 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1299  TatD family hydrolase  31.35 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0199  TatD-related deoxyribonuclease  28.57 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  36.08 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0883  mttC protein, putative  35.16 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.162924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  32.16 
 
 		 458 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0212  TatD family deoxyribonuclease  28.4 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  32.16 
 
 		 458 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  28.06 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0222  TatD family deoxyribonuclease  28.4 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  31.78 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  32.64 
 
 		 462 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  31.25 
 
 		 257 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  31.25 
 
 		 257 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  30.86 
 
 		 464 aa  118  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  34.63 
 
 		 259 aa  118  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  29.8 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  29.8 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  29.8 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  29.8 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  32.95 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  31.76 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  29.41 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  29.41 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0198  TatD-related deoxyribonuclease  28 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.865826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0883  TatD family hydrolase  26.91 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0231  putative deoxyribonuclease, TatD family  27.6 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  29.41 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  33.73 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  29.41 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  30.23 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  29.02 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  34.5 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  34.11 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  29.02 
 
 		 255 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  30.62 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5088  putative deoxyribonuclease, TatD family  28 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.279248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  30.65 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  30.62 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  32.44 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  32.95 
 
 		 270 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0238  putative deoxyribonuclease, TatD family  27.2 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0202  TatD-related deoxyribonuclease  27.2 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  31.01 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  30.31 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  29.3 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  29.02 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  28.46 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  34.23 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  34.9 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  34.03 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  30.31 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  25.68 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  30.2 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  25.68 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  33.73 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  33.98 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  28.91 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  31.76 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0817  TatD family hydrolase  27.71 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.240566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  34.31 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  29.34 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  31.25 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  30.28 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  31.13 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  29.02 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  30.56 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  30.04 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0006  TatD family hydrolase  26.51 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.637647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  28.12 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  30.08 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1100  TatD family hydrolase  26.51 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.162868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  32.02 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  31.89 
 
 		 459 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  31.52 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  31.25 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  28.96 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  31.03 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  30.65 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  30.57 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  32.06 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  32.92 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  31.44 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>