More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1855 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1855  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00309398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1040  TatD-related deoxyribonuclease  69 
 
 		 250 aa  299  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  37.56 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0238  putative deoxyribonuclease, TatD family  37.75 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0231  putative deoxyribonuclease, TatD family  37.38 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0212  TatD family deoxyribonuclease  36.41 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0222  TatD family deoxyribonuclease  36.41 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0256  putative deoxyribonuclease, TatD family  37.56 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0198  TatD-related deoxyribonuclease  36.41 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.865826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5088  putative deoxyribonuclease, TatD family  37.75 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.279248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0199  TatD-related deoxyribonuclease  36.1 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0202  TatD-related deoxyribonuclease  36.41 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2067  TatD-related deoxyribonuclease  30.77 
 
 		 252 aa  104  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  29.03 
 
 		 461 aa  95.5  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  28.77 
 
 		 606 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  27.91 
 
 		 458 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  27.91 
 
 		 458 aa  89  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  29.17 
 
 		 268 aa  88.2  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  30.7 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  25.57 
 
 		 256 aa  85.1  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  29.95 
 
 		 464 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  25.12 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  31.16 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1299  TatD family hydrolase  28.77 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  26.51 
 
 		 462 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  27.14 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  27.14 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  27.14 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  27.14 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  28.38 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  27.14 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  27.14 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  27.14 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  29.49 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  27.14 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  29.03 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  27.14 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  27.23 
 
 		 256 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  30.81 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1998  TatD-related deoxyribonuclease  32.18 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  26.76 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  27.14 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  28.51 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  27.1 
 
 		 255 aa  78.2  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  28.05 
 
 		 258 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  26.48 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  25.69 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  28.05 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1778  TatD-related deoxyribonuclease  29.25 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  30.22 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  24.53 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  28.57 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  27.44 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  25.71 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  28.83 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  26.67 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  28.92 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  24.88 
 
 		 457 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  26.48 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  26.48 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  27.88 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1779  TatD-related deoxyribonuclease  29.83 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  28.84 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  27.1 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  27.06 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  26.48 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  24.88 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  24.88 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  26.03 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  25 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  28.76 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  30.04 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  27.52 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  26.98 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  26.73 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  27.44 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  28.44 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  25.93 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  30.22 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2208  TatD-related deoxyribonuclease  29.86 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1551  Mg-dependent DNase  26.39 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  28.31 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  26.61 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  27.44 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  27.05 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  26.98 
 
 		 255 aa  72  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  27.06 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  27.05 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  27.05 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  27.05 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  28.17 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  28.77 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  23.96 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0006  TatD family hydrolase  24.04 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.637647  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  25.6 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  27.65 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1823  TatD-related deoxyribonuclease  28.78 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00210636  hitchhiker  0.000000000367552 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  26.39 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  26.96 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1100  TatD family hydrolase  24.27 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.162868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>