More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1040 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1040  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
250 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1855  TatD-related deoxyribonuclease  69 
 
 
218 aa  299  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00309398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0238  putative deoxyribonuclease, TatD family  36.61 
 
 
254 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0199  TatD-related deoxyribonuclease  36.22 
 
 
256 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5088  putative deoxyribonuclease, TatD family  36.61 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.279248  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  35.04 
 
 
265 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0198  TatD-related deoxyribonuclease  35.29 
 
 
260 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.865826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0231  putative deoxyribonuclease, TatD family  36.08 
 
 
254 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0212  TatD family deoxyribonuclease  35.29 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0222  TatD family deoxyribonuclease  35.29 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0256  putative deoxyribonuclease, TatD family  34.65 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0202  TatD-related deoxyribonuclease  35.69 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  27.97 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  30.62 
 
 
457 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  28.68 
 
 
606 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1299  TatD family hydrolase  29.69 
 
 
251 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2067  TatD-related deoxyribonuclease  27.34 
 
 
252 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  29.18 
 
 
462 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  26.27 
 
 
461 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  29.62 
 
 
256 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  29.18 
 
 
458 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.79 
 
 
255 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  29.18 
 
 
458 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  28.79 
 
 
255 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  29.07 
 
 
263 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  28.4 
 
 
255 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  28.35 
 
 
255 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  28.4 
 
 
255 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  27.91 
 
 
256 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  28.02 
 
 
255 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  28.02 
 
 
255 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  28.02 
 
 
255 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  29.07 
 
 
257 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.02 
 
 
255 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  31.18 
 
 
258 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  28.4 
 
 
255 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  30.92 
 
 
259 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  29.62 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1778  TatD-related deoxyribonuclease  28.4 
 
 
281 aa  99.8  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  26.17 
 
 
462 aa  99.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  30.8 
 
 
258 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  28.85 
 
 
255 aa  99  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  26.64 
 
 
255 aa  99  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  28.02 
 
 
255 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  31.42 
 
 
259 aa  98.6  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  30.8 
 
 
258 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  28.57 
 
 
256 aa  98.6  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  28.79 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  28.91 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  29.01 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  27.24 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  28.24 
 
 
256 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  27.06 
 
 
255 aa  95.9  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  27.4 
 
 
251 aa  95.5  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  30 
 
 
273 aa  95.1  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  29.07 
 
 
261 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  29.43 
 
 
464 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  31.56 
 
 
256 aa  94.4  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  28.24 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  28.35 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  29.66 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  27.63 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  28.9 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  26.74 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  28.35 
 
 
278 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  27.97 
 
 
259 aa  92.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  27.52 
 
 
263 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  28.68 
 
 
260 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  28.68 
 
 
260 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  28.74 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  28.41 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  31.42 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  28.68 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  28 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  28.29 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  28.4 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  29.01 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  26.67 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  28.69 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  25.77 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  27.2 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1779  TatD-related deoxyribonuclease  27.84 
 
 
228 aa  90.5  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  29.06 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  27.13 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  27.13 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  26.64 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0199  TatD-related deoxyribonuclease  26.29 
 
 
242 aa  89.7  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  24.62 
 
 
266 aa  89.4  5e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  27.91 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0017  deoxyribonuclease, TatD family  24.81 
 
 
265 aa  89  6e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  27.2 
 
 
255 aa  88.6  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  27.52 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  25.98 
 
 
257 aa  88.6  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  26.12 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  28.74 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  26.95 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  27.31 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  25.83 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  28.35 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  27.97 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>