More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1308 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1308  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 237 aa  487  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.700571  normal  0.456144 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1295  TatD-related deoxyribonuclease  45.57 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1823  TatD-related deoxyribonuclease  44.73 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00210636  hitchhiker  0.000000000367552 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2071  TatD-related deoxyribonuclease  45.15 
 
 		 234 aa  224  8e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.270704  normal  0.0636834 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1025  TatD-related deoxyribonuclease  44.73 
 
 		 236 aa  223  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609004 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0199  TatD-related deoxyribonuclease  42.92 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1779  TatD-related deoxyribonuclease  36.44 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1998  TatD-related deoxyribonuclease  35.94 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  30.52 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1778  TatD-related deoxyribonuclease  30.4 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0199  TatD-related deoxyribonuclease  29.37 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0231  putative deoxyribonuclease, TatD family  28 
 
 		 254 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0202  TatD-related deoxyribonuclease  27.6 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0198  TatD-related deoxyribonuclease  27.6 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.865826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0212  TatD family deoxyribonuclease  27.2 
 
 		 254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0238  putative deoxyribonuclease, TatD family  26.4 
 
 		 254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0222  TatD family deoxyribonuclease  27.2 
 
 		 254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  28.46 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  29.69 
 
 		 458 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  30.04 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  27.09 
 
 		 457 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  26.95 
 
 		 606 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0256  putative deoxyribonuclease, TatD family  27.6 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  28.91 
 
 		 458 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  29.08 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  29.57 
 
 		 462 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5088  putative deoxyribonuclease, TatD family  26.4 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.279248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  28.06 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  26.4 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2067  TatD-related deoxyribonuclease  28.69 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  29.25 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  28.35 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  27.84 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  28.4 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  27.63 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  26.98 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  25.79 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  28.35 
 
 		 265 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  28.35 
 
 		 265 aa  99  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  28.35 
 
 		 265 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  28.35 
 
 		 265 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  27.2 
 
 		 257 aa  99  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  28.35 
 
 		 265 aa  99  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  28.06 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  30.04 
 
 		 265 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2900  Mg-dependent DNase TatD  25.61 
 
 		 255 aa  98.6  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000278617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  28.35 
 
 		 265 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  28.35 
 
 		 265 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  28.35 
 
 		 265 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  28.35 
 
 		 265 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  27.45 
 
 		 255 aa  98.2  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  26.98 
 
 		 462 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  27.27 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1299  TatD family hydrolase  25 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  28.24 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  27.45 
 
 		 269 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  27.45 
 
 		 269 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  26.19 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1885  hydrolase, TatD family  29.02 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16447  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  27.45 
 
 		 269 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  27.95 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  26.98 
 
 		 464 aa  96.7  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  27.56 
 
 		 265 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  27.56 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  27.56 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  27.56 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  25.39 
 
 		 261 aa  95.5  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  28.06 
 
 		 263 aa  95.5  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  27.17 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  26.61 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  26.19 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  29.64 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  27.17 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  29.8 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  24.02 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  27.67 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  28.46 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  24.02 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  24.02 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2262  TatD-related deoxyribonuclease  31.71 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.225639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3651  TatD-related deoxyribonuclease  25.4 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  26.4 
 
 		 254 aa  92  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  29.41 
 
 		 257 aa  92  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  24.02 
 
 		 260 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  25 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  28.29 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  26.78 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  26.69 
 
 		 461 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  25.88 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  25.39 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  30.86 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  28.46 
 
 		 263 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  26.56 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  25.38 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  27.84 
 
 		 264 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  24.61 
 
 		 258 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  27.27 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  28.46 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  25 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  25.78 
 
 		 263 aa  89  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>