More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf006 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf006  TatD-related DNase  100 
 
 
253 aa  520  1e-147  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  38.49 
 
 
255 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  35.83 
 
 
256 aa  156  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  33.2 
 
 
263 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  35 
 
 
257 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.97 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  35.97 
 
 
255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  35.97 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  35.97 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.97 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  35.97 
 
 
255 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  35.97 
 
 
255 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  36.22 
 
 
257 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  36.22 
 
 
257 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.97 
 
 
255 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  37.4 
 
 
255 aa  151  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  35.97 
 
 
255 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.57 
 
 
255 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  33.6 
 
 
256 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  34.38 
 
 
251 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  34.39 
 
 
256 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0211  TatD family hydrolase  34.26 
 
 
269 aa  148  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  34.6 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  37.15 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  34.24 
 
 
260 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  34.22 
 
 
256 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  33.86 
 
 
258 aa  141  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  34.39 
 
 
255 aa  141  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  30.04 
 
 
269 aa  140  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  34.1 
 
 
255 aa  139  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  37.32 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  31.44 
 
 
267 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  35.91 
 
 
258 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  33.72 
 
 
258 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  30.77 
 
 
256 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  31.89 
 
 
256 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  33.47 
 
 
260 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  31.89 
 
 
260 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  31.89 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1227  hydrolase, TatD family  35.32 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  33.86 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  32.14 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  31.76 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0528  hydrolase, TatD family  31.03 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  33.73 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  31.5 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  31.37 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  29.41 
 
 
464 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  31.01 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  33.2 
 
 
256 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  34.08 
 
 
265 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  30.31 
 
 
255 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  33.63 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  31.1 
 
 
257 aa  132  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  30.62 
 
 
258 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  31.27 
 
 
265 aa  132  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  35.29 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  34.96 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  33.63 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  30.31 
 
 
255 aa  131  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  33.2 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  33.04 
 
 
285 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  31.27 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  33.94 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  31.6 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  31.27 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  31.27 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  31.76 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  31.27 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  33.07 
 
 
253 aa  129  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  30.89 
 
 
265 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  34.89 
 
 
286 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  31.89 
 
 
256 aa  129  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  30.89 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  32.74 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  30.89 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  32.81 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  30.89 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 
257 aa  128  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  30.86 
 
 
257 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  31.37 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  32.13 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  37.56 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  33.33 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  31.06 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  29.8 
 
 
462 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  32.16 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  31.1 
 
 
256 aa  126  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  35.8 
 
 
266 aa  126  3e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  31.23 
 
 
271 aa  126  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  31.4 
 
 
458 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  35.2 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  32.42 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0429  deoxyribonuclease  31.27 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  30.86 
 
 
257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  29.46 
 
 
264 aa  125  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  30.98 
 
 
258 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  29.57 
 
 
265 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  30.08 
 
 
258 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>