More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0966 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0966  TatD family hydrolase  100 
 
 		 273 aa  565  1e-160  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.732355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  30.65 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  30.2 
 
 		 258 aa  89  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  32.07 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  32.61 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  26.74 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  31.69 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  28.4 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  28.89 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  30.98 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  27.01 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  27.17 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  30.43 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  31.15 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  26.91 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  28.04 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  26.91 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1279  TatD family hydrolase  27.11 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.549557  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  26.94 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  26.94 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  26.94 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  28.92 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  30 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  24.03 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  27.06 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2106  TatD-related deoxyribonuclease  26.77 
 
 		 258 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  27.08 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2208  TatD-related deoxyribonuclease  29.79 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  29.9 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  27.31 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  27.91 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2036  TatD-related deoxyribonuclease  26.26 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  31.87 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  31.06 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  31.53 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1824  TatD-related deoxyribonuclease  27.78 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  29.55 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  30.59 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  30.48 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  30 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  30.41 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  27.03 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  27.55 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  26.64 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  27.57 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1521  Sec-independent protein translocase TatD  29.41 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0926881 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  27.24 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  28.31 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2311  TatD-related deoxyribonuclease  25.87 
 
 		 253 aa  72  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  29.32 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  27.95 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  27.42 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  23.64 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  28.11 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  30.43 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3175  TatD-related deoxyribonuclease  26.86 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  30.05 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  31.06 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  28.72 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  28 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  29.12 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  31.38 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  29.38 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18871  TatD family deoxyribonuclease  31.25 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  27.71 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  27.71 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  29.38 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  31.91 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  27.06 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  31.25 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  31.38 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  26.79 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  30.09 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0194  hydrolase, TatD family protein  28.1 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0500604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1017  putative deoxyribonuclease, TatD family  31.25 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  26.57 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  27.53 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  29.57 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  27.71 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  29.84 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  29.3 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  29.3 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  31.38 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  29.69 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  29.69 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  29.03 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  32.07 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2029  TatD-related deoxyribonuclease  24.55 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.755342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  25.82 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  29.03 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  26.36 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  32.62 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  31.38 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  29.69 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  31.9 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  30.85 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  31.9 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  29.03 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  26.1 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>