More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3175 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3175  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 275 aa  558  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  32.79 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  34.11 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  36.02 
 
 		 261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  34.66 
 
 		 252 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  31.25 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  36.33 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  33.07 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  34.77 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  33.07 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  28.91 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16901  TatD family deoxyribonuclease  31.78 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  32.02 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16771  TatD family deoxyribonuclease  31.54 
 
 		 264 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  31.37 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  32.55 
 
 		 254 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  33.98 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  32.3 
 
 		 261 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  30.15 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  31.27 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  29.96 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  31.27 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  32.03 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  30.98 
 
 		 459 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  30.53 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  32.03 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  31.4 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  36.36 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  32.68 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  32.68 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  34.36 
 
 		 262 aa  122  9e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  32.33 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  38.17 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1579  putative deoxyribonuclease, TatD family  30.38 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  32.33 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1017  putative deoxyribonuclease, TatD family  29.6 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  35.5 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18871  TatD family deoxyribonuclease  29.6 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  31.89 
 
 		 464 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  33.07 
 
 		 257 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  33.07 
 
 		 257 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  37.79 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  32.57 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  32.94 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  35.06 
 
 		 277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  30.77 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  30.47 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  31.42 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  32.56 
 
 		 262 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  32.17 
 
 		 266 aa  118  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  32.69 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  33.07 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  32.42 
 
 		 457 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  30.99 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  32.17 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1087  TatD-related deoxyribonuclease  32.13 
 
 		 252 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  29.76 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  32.57 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  32.94 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  32.8 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  32.43 
 
 		 262 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  29.76 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  34.11 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  32.16 
 
 		 262 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3606  TatD family hydrolase  35.78 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000130951  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  28.24 
 
 		 258 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  29.76 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  29.76 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  29.76 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  29.76 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  29.57 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  32.35 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  32.35 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  31.78 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  30.89 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  34.11 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  31.4 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  34.11 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  32.52 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  32.35 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  32.35 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  29.76 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  32.95 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  29.48 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  32.35 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  32.31 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  31.4 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  33.2 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  31.68 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  36.05 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  32.34 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  33.98 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0212  hydrolase, TatD family  30.77 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.02285e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  30.68 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>