78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50114 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_50114  predicted protein  100 
 
 		 338 aa  695    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.975027  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04048  Cut9 interacting protein Scn1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03870)  31.74 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900915 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1824  TatD-related deoxyribonuclease  27.59 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2106  TatD-related deoxyribonuclease  26.44 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47161  predicted protein  24.24 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0374083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2036  TatD-related deoxyribonuclease  26.44 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  22.27 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  24.09 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  23.18 
 
 		 264 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1277  TatD-related deoxyribonuclease  23.95 
 
 		 223 aa  53.9  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  22.73 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  22.27 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  22.64 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  21.52 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1996  TatD-related deoxyribonuclease  25.33 
 
 		 169 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11690  predicted protein  22.92 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  25.58 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0250  TatD-related deoxyribonuclease  21.36 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  23.9 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  24.69 
 
 		 264 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  24.39 
 
 		 264 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  28.47 
 
 		 274 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  24.39 
 
 		 260 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  25.79 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2262  TatD-related deoxyribonuclease  25.29 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.225639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1431  TatD-related deoxyribonuclease  27.15 
 
 		 272 aa  50.1  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  24.39 
 
 		 260 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  23.66 
 
 		 266 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  19.91 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  21.4 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00230  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.231233  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  31 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  22.15 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  25.85 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  26.61 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2775  TatD-related deoxyribonuclease  24.43 
 
 		 217 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.115989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  22.27 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  34 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  29.33 
 
 		 258 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  28.1 
 
 		 253 aa  47.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0194  hydrolase, TatD family protein  25.88 
 
 		 269 aa  47.4  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0500604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  24.17 
 
 		 257 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  29.09 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  25 
 
 		 256 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  26.61 
 
 		 256 aa  46.2  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  29.49 
 
 		 256 aa  46.2  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  32 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  24.49 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  21.8 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3175  TatD-related deoxyribonuclease  25.6 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  21.89 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  22.47 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  30.61 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0966  TatD family hydrolase  28.83 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.732355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  32 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  21.33 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  26.28 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  25.93 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  33.85 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  21.36 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  24.48 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  25 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  22.29 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  26.53 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1227  hydrolase, TatD family  28.06 
 
 		 253 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  26.22 
 
 		 253 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  25.64 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  22.55 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  25 
 
 		 264 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  25.6 
 
 		 275 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1109  TatD family hydrolase  21.37 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  27.52 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  21.95 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  26.05 
 
 		 293 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  25 
 
 		 290 aa  43.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  24.53 
 
 		 255 aa  42.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  28.3 
 
 		 267 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  20.79 
 
 		 260 aa  42.7  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>