More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4182 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4182  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 218 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2775  TatD-related deoxyribonuclease  36.92 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.115989  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0199  TatD family protein  37.38 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0828  TatD-related deoxyribonuclease  31.52 
 
 		 194 aa  95.9  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.137921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  35.48 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  31.87 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  36.43 
 
 		 276 aa  86.3  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  29.78 
 
 		 254 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  31.32 
 
 		 255 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  29.78 
 
 		 254 aa  84.7  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  30.88 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  29.33 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  28.69 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  31.68 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  29.83 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  30.46 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  33.55 
 
 		 255 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  27.11 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  31.88 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  30.32 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  36.61 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  28.63 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  28.44 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  30.67 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  24.81 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  27.67 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  34.24 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  31.72 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  35.33 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  33.06 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  38.71 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  28.05 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  36.97 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  29.44 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  30.85 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  31.58 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  24.41 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1195  hydrolase, TatD family  29.76 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  32.41 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0833  TatD family hydrolase  38.71 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3629  TatD-related deoxyribonuclease  38.71 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.978125  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  31.54 
 
 		 464 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  28.85 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  33.06 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  30.18 
 
 		 272 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  31.11 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  28.64 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3606  TatD family hydrolase  31.64 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000130951  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  29.46 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  31.17 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1277  TatD-related deoxyribonuclease  26.32 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  30.23 
 
 		 264 aa  64.7  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  27.34 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  31.38 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  26.09 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  31.48 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0999  TatD-related deoxyribonuclease  34.41 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000160958  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  26.16 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0194  hydrolase, TatD family protein  24.76 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0500604  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  25.46 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  29.27 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  27.13 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  27.89 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  27.89 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  31.32 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  31.54 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  31.46 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  31.09 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  31.98 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  29.46 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  31.58 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1579  putative deoxyribonuclease, TatD family  30.72 
 
 		 264 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  27.62 
 
 		 264 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  29.79 
 
 		 462 aa  62  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  31.15 
 
 		 258 aa  62  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  25.37 
 
 		 257 aa  62  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16901  TatD family deoxyribonuclease  30.72 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  32.33 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  28.39 
 
 		 265 aa  61.6  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  30.23 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  27.75 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  31.79 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl048  Mg2+ dependent DNAse  31.5 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  27.52 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1521  Sec-independent protein translocase TatD  28.5 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0926881 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  28.9 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  32.21 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  34.19 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  30.12 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  27.95 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1824  TatD-related deoxyribonuclease  30.97 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  32.56 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  30.59 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  26.34 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>