More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0828 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0828  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 194 aa  401  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.137921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2775  TatD-related deoxyribonuclease  36.92 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.115989  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0199  TatD family protein  34 
 
 		 237 aa  101  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4182  TatD-related deoxyribonuclease  31.52 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 		 263 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  36.49 
 
 		 254 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  35.81 
 
 		 254 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  35.81 
 
 		 254 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  35.81 
 
 		 254 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  29.61 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  32.93 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  30.86 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  32.1 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  33.8 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  32.88 
 
 		 256 aa  78.2  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  30.87 
 
 		 257 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  31.41 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  29.3 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  27.22 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  33.78 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  31.18 
 
 		 254 aa  74.7  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  34.48 
 
 		 256 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  31.03 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02995  putative deoxyribonuclease  29.71 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  32.41 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  32.64 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  31.51 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  31.03 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  34.69 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  32.43 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  32.68 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  35.67 
 
 		 262 aa  71.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  35.67 
 
 		 262 aa  71.2  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  31.85 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  34.25 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.1 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  32.21 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  32.72 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  30.82 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  33.1 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  32.64 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  33.1 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1277  TatD-related deoxyribonuclease  31.22 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  32.88 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  32.65 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  31.29 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  33.56 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  31.47 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  30.34 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  31.25 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  26.92 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl048  Mg2+ dependent DNAse  31.29 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  34.46 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  29.66 
 
 		 257 aa  68.2  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  30.67 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  31.94 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  31.94 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  31.94 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  29.7 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  31.33 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  31.72 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0999  TatD-related deoxyribonuclease  31.37 
 
 		 253 aa  67  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000160958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  34.48 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  33.78 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  29.19 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  34.25 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  31.72 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  31.72 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  34.25 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  31.72 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  31.72 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  31.72 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  27.08 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  31.72 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  31.25 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1227  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  29.93 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  31.72 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  31.29 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  31.51 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0429  deoxyribonuclease  28.77 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  32.89 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  33.33 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  31.25 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  32.52 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  31.14 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  34.03 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  29.93 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  30.34 
 
 		 257 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  29.66 
 
 		 275 aa  65.1  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  31.93 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0528  hydrolase, TatD family  29.22 
 
 		 266 aa  64.7  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  30.14 
 
 		 267 aa  64.7  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  31.03 
 
 		 265 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  31.03 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  27.89 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  31.03 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  31.03 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>